Prise en charge des jours de carence des arrêts maladie : dans quels secteurs les salariés sont-ils les mieux protégés ?

Depuis plusieurs mois, Sébastien Lecornu travaille sur une régulation plus stricte des arrêts maladie. En cause, la hausse continue des dépenses d'indemnités journalières, qui pèse sur les comptes de la Sécurité sociale. Allongement du délai de carence, révision des indemnités… Plusieurs pistes sont sur la table pour endiguer la dette.

C'est dans ce contexte que la Dares, service statistique du ministère du Travail, publie un état des lieux de l'existant. Son Focus n° 39, sorti en septembre 2026, s'appuie sur l'enquête Acemo, menée en 2025 auprès de 274 000 entreprises privées d'au moins dix salariés, soit 16,5 millions de salariés.

L’étude dresse un premier constat. Elle pointe le fait que la prise en charge des trois jours de carence, ces jours non indemnisés par la Sécurité sociale, dépend presque entièrement de la bonne volonté de l'employeur, ou de la convention collective à laquelle il est rattaché.

La métallurgie et chimie, en tête

Dans la métallurgie et la sidérurgie, 85 % des entreprises indemnisent tout ou partie de la carence, un record. Suivent les bureaux d'études et les prestations de services aux entreprises, à 74 %, les banques et assurances à 71 %, les services de l'automobile à 73 %, la chimie et la pharmacie à 70 %, ainsi que le verre et les matériaux de construction, à 69 %.

Ces branches ont un point commun : une tradition de négociation collective bien installée, et une main-d'œuvre qualifiée et stable. Deux ingrédients qui, historiquement, tirent la protection sociale vers le haut.

L'hôtellerie-restauration, loin derrière

À l'inverse, l'hôtellerie-restauration-tourisme plafonne à 13 %. Le commerce à prédominance alimentaire fait à peine mieux, à 16 %. Le nettoyage, la manutention, la récupération et la sécurité suivent, à 20 %.

Il s’agit de trois secteurs marqués par les contrats courts, un turnover élevé et une main-d'œuvre moins qualifiée. Autant de freins à la négociation d'une couverture complémentaire.

Taille et dialogue social, deux variables qui recoupent le classement

Le secteur ne joue pas seul, la taille de l'entreprise compte aussi. Ainsi, 41 % des structures de 10 à 49 salariés indemnisent la carence, contre 81 % de celles de 500 salariés ou plus. À caractéristiques comparables, la Dares chiffre à 1,9 fois la propension d'une grande entreprise à indemniser, par rapport à une petite.

Le dialogue social pèse tout autant. 68 % des entreprises où se tiennent des négociations collectives indemnisent la carence, contre 40 % de celles qui n'en tiennent pas. Avec une représentation syndicale, le taux monte à 71 %, tandis que sans elle, il tombe à 34 %. Ces deux facteurs recoupent largement la hiérarchie sectorielle. Autrement dit, les branches les mieux couvertes concentrent aussi les grandes entreprises et le dialogue social le plus actif.

Reste la question de la source de l’indemnisation. Dans 66 % des cas, celle-ci provient d'un accord de branche ou d'une convention collective. L'accord d'entreprise et la décision unilatérale de l'employeur se partagent le reste, à 9 % chacun.