Thèse Rôle du Médiateur dans les Conflits Réplication-Transcription & le Maintien de l'Intégrité du Génome H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : IGH - Institut de Génétique Humaine
Direction de la thèse : Jérôme POLI ORCID 0000000180915507
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Le stress réplicatif est une des causes majeures de l'instabilité génétique et contribue au processus oncogénique. Les études récentes montrent que la transcription du génome est la source endogène prépondérante de blocage de la machinerie de réplication (Gomez-Gonzales et al., 2019). Dans les phases précoces du cancer induit par les oncogènes, la perte de coordination entre les programmes de transcription et de réplication est la source majeure de stress réplicatif et d'instabilité du génome (Macheret & Halazonetis, 2018). Pourtant, la manière dont les cellules contrôlent la transcription durant la réplication de l'ADN reste méconnu. Notre équipe a montré que le checkpoint de phase S, par l'activité de la kinase Mec1ATR, atténue la transcription dès l'entrée en phase S, en entraînant une dégradation de Rpb1, une sous-unité de l'ARN polymérase II (RNAPII) (Poli et al., 2016; Hurst et al. 2021). Plus récemment, en utilisant des approches de spectrométrie de masse, nous avons identifié le complexe Médiateur comme une cible de Mec1ATR. Deux études récentes suggèrent un lien étroit entre la kinase du checkpoint Mec1ATR et le Médiateur dans le contrôle des gènes codant les histones (Marmolejo et al. 2026) et dans l'extinction transcriptionnelle associée aux cassures doubles brins (Memisoglu et al., 2025). Nos données préliminaires suggèrent que le Médiateur promeut la progression des fourches de réplication en condition de stress. Le projet de thèse proposé vise à déterminer si et comment le Médiateur promeut la réplication au travers des régions transcrites, et ainsi protéger les cellules des effets négatifs des conflits transcription-réplication. Pour répondre à cette question, nous utiliserons les modèles levure (S. cerevisiae) et des lignées cellulaires humaine.

Bien que le rôle du médiateur dans le processus transcriptionnel ait été caractérisé finement, son implication dans le contrôle de la transcription durant la réplication est inexistante. Deux études récentes suggèrent un lien étroit entre la kinase du checkpoint Mec1ATR et le contrôle de la transcription via le complexe du Médiateur. Tout d'abord en condition physiologique, où Mec1ATR participe au contrôle de l'expression des gènes codant les histones en ciblant Med1 (Marmolejo et al. 2026), mais aussi dans un contexte de dommage de l'ADN (cassures doubles brins) où le Mediateur est requis pour éteindre transitoirement la transcription (Memisoglu et al., 2025). Les données obtenues par notre laboratoire mettent en évidence que le lien fonctionnel entre Mec1ATR et le Médiateur existent aussi durant la phase S. De part son rôle crucial dans la transcription, le Médiateur pourrait faire le lien entre la signalisation du checkpoint de phase S et l'ARN polymérase II. Il est important de noter que des mutations dans plusieurs sous-unités du Médiateur ont été associées à diverses pathologies humaines incluant des Cancers, des maladies neurodégénératives, métaboliques et cardiovasculaires (Maalouf et al., 2024).

L'objectif principal du projet est d'étudier l'implication du Médiateur dans la gestion des conflits transcription réplication et les liens avec l'instabilité génétique.

modèle levure S. cerevisiae, techniques de biologie moléculaire, cellulaire et génétique classique et à l'échelle de la fibre unique / cellule unique (microscopie haute-résolution). En fonction de ses compétences, le candidat sera amené à mettre en oeuvre des approches de séquençage à l'échelle du génome entier (expérience + analyse des données bioinformatique) tel que l'immunoprécipitation de chromatine (ChIP-qPCR et/ou seq).