Thèse Décryptage des Mécanismes Moléculaires de l'Inhibition de Mtor Médiée par Unc5b Identification des Médiateurs Moléculaires par Criblage Protéomique et Fonctionnel H/F

Doctorat_Gouv

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1
École doctorale : CanBioS - Cancérologie, Biologie, Santé de Lyon
Laboratoire de recherche : CRCL - CENTRE DE RECHERCHE EN CANCÉROLOGIE DE LYON
Direction de la thèse : Andrea PARADISI ORCID 2218000322183859
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

La mise au point de stratégies thérapeutiques efficaces contre le cancer repose sur une compréhension fine des mécanismes permettant aux cellules tumorales d'échapper à l'apoptose, un processus essentiel pour éliminer les cellules altérées et préserver l'intégrité tissulaire. Parmi ces mécanismes, les récepteurs à dépendance, comme UNC5B, occupent une place centrale : en l'absence de leur ligand, netrin-1, ils induisent activement la mort cellulaire (1-3). À l'inverse, la surexpression de netrin-1, fréquente dans de nombreux cancers, confère un avantage sélectif aux tumeurs en bloquant l'apoptose médiée par UNC5B, favorisant ainsi leur progression (4-9). Dans ce contexte, l'anticorps thérapeutique NP137, développé par Netris Pharma pour neutraliser netrin-1, a montré des résultats encourageants en essais cliniques précoces, confirmant son potentiel comme traitement ciblé pour les cancers dépendants de cette molécule (10-12). Toutefois, les voies moléculaires précises par lesquelles UNC5B déclenche l'apoptose en réponse à l'absence de netrin-1 restent partiellement élucidées, limitant l'optimisation de cette approche thérapeutique.
Des résultats préliminaires obtenus dans notre laboratoire indiquent qu'UNC5B module l'activité de la voie mTOR, un régulateur central de la synthèse protéique et de la survie cellulaire. Ces observations suggèrent que l'activation d'UNC5B, en l'absence de netrin-1, pourrait entraîner une inhibition de mTOR, conduisant à une réduction de la traduction de protéines anti-apoptotiques comme Mcl-1. Cette régulation semble être un événement clé dans la mort cellulaire induite par UNC5B. Cependant, les intermédiaires moléculaires reliant UNC5B à mTOR restent inconnus. Leur identification est cruciale pour comprendre comment un récepteur membranaire comme UNC5B module une voie intracellulaire aussi centrale que mTOR.
Ce projet vise à élucider les mécanismes moléculaires par lesquels UNC5B transmet son signal pro-apoptotique vers mTOR. Pour atteindre cet objectif, nous nous appuierons sur trois axes principaux : (i) Identification des partenaires protéiques d'UNC5B en conditions pro-apoptotiques. Nous utiliserons des techniques de criblage de proximité (APEX2/BioID2) pour identifier les protéines interagissant avec UNC5B en absence de nétrine-1. Ces protéines pourraient inclure des médiateurs impliqués dans la régulation de mTOR. (ii) Analyse protéomique des cibles ubiquitinées et des protéines régulées par UNC5B. Nous réaliserons une analyse protéomique globale des protéines ubiquitinées et des protéines dont l'abondance est modifiée après induction d'UNC5B. En effet, nos données préliminaires suggèrent qu'UNC5B module l'activité de la voie mTOR via un mécanisme impliquant le complexe ubiquitine-ligase CRL3/COMMD2. Cela permettra d'identifier des cibles potentielles du ce complexe, ainsi que des protéines dont la disparition pourrait expliquer l'inhibition de mTOR. (iii) Validation fonctionnelle des gènes candidats issus d'un criblage CRISPR/Cas9. Nous validerons le rôle des gènes candidats dans la transmission du signal d'UNC5B vers mTOR. Nous utiliserons des tests de knockdown, des analyses de phosphorylation de mTOR, et des mesures de traduction protéique pour confirmer leur implication.
Ce projet pourrait révéler que l'anticorps thérapeutique NP137, actuellement en essais cliniques, agit non seulement en bloquant netrin-1, mais aussi comme un inhibiteur tumeur-spécifique de mTOR. Contrairement aux inhibiteurs classiques de mTOR (comme l'everolimus ou le temsirolimus) (13), qui ciblent mTOR de manière ubiquitaire et entraînent des toxicités systémiques sévères (pneumopathie, stomatite, anémie) (14), NP137 pourrait inhiber mTOR uniquement dans les cellules tumorales surexprimant netrin-1, épargnant ainsi les tissus sains. Cette spécificité tumorale est cruciale, car elle pourrait offrir une alternative plus sûre et plus efficace, en particulier en combinaison avec d'autres thérapies anti-cancéreuses.

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