Thèse Traduction Ribosomale chez une Archée du Microbiote Intestinal H/F

École polytechnique

Établissement : École polytechnique
École doctorale : Ecole Doctorale de l'Institut Polytechnique de Paris
Laboratoire de recherche : BIOC - Laboratoire de Biologie Structurale de la Cellule
Direction de la thèse : Emmanuelle SCHMITT ORCID 000000017532338X
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-29T23:59:59

Les archées productrices de méthane constituent le groupe prédominant d'archées dans le microbiote intestinal humain, Methanobrevibacter smithii étant l'archée la plus répandue. Les études récentes laissent entrevoir un rôle des méthanogènes dans les maladies chroniques et l'inflammation. Ainsi, disposer de moyens de contrôler l'abondance des archées dans le microbiote pourrait permettre de mieux comprendre leur impact sur la santé humaine et mettre en place des thérapies. L'équipe « mécanismes de la traduction » (Laboratoire de Biologie Structurale de la Cellule - UMR 7654 - École Polytechnique) propose un sujet de thèse pour étudier les mécanismes de traduction ribosomale du commensal humain Methanobrevibacter smithii en tant que système archée modèle. En effet, malgré son importance possible pour la santé humaine, aucune information structurale de la traduction ribosomale chez les méthanogènes n'a encore été obtenue.
L'objectif du projet est de mettre en évidence les spécificités de l'appareil de traduction de M. smithii. Pour ce faire, les structures cryo-EM des complexes de traduction seront déterminées. Les sites de liaison des antibiotiques les plus courants seront étudiés ainsi que la réponse au stress. Ces nouvelles connaissances seront utilisées pour définir des stratégies permettant le contrôle de la traduction chez ces archées. Ce projet sera mené en collaboration avec les Drs Gribaldo et Borrel à l'Institut Pasteur.
Ce projet de thèse bénéficiera de l'infrastructure exceptionnelle du laboratoire BIOC de l'Ecole Polytechnique, et de l'accès privilégié de l'équipe au CIMEX (Centre Interdisciplinaire de Microscopie Electronique de l'X), avec son microscope Titan Themis 300kV équipé d'un détecteur d'électrons directs Falcon 3. Il permettra à l'étudiant d'acquérir des compétences en biologie moléculaire, biochimie, biologie structurale, bioinformatique et analyse évolutive.

Les archées productrices de méthane constituent le groupe prédominant d'archées dans le microbiote intestinal humain, Methanobrevibacter smithii étant l'archée la plus répandue. Les études récentes laissent entrevoir un rôle des méthanogènes dans les maladies chroniques et l'inflammation. Ainsi, disposer de moyens de contrôler l'abondance des archées dans le microbiote pourrait permettre de mieux comprendre leur impact sur la santé humaine et mettre en place des thérapies. L'équipe « mécanismes de la traduction » (Laboratoire de Biologie Structurale de la Cellule - UMR 7654 - École Polytechnique) propose un sujet de thèse pour étudier les mécanismes de traduction ribosomale du commensal humain Methanobrevibacter smithii en tant que système archée modèle. En effet, malgré son importance possible pour la santé humaine, aucune information structurale de la traduction ribosomale chez les méthanogènes n'a encore été obtenue.