Scientist - Proteomics H/F

Pôle Emploi

Vous faites partie de l'équipe de Science Analytique et de Découverte, la protéomique étant une activité récemment établie. Dans une perspective de croissance de l'activité, nous recherchons un(e) scientifique (doctorat) spécialisé(e) en protéomique. Vous êtes encadré(e) par la Responsable des Opérations de Métabolomique/Protéomique et contribuerez au succès des projets de R&D à travers la caractérisation du protéome/peptidome nécessaire au développement de nouveaux procédés et de nouveaux produits.

Le/la candidat(e) retenu(e) sera responsable du développement, de l'adaptation et de l'application de workflows protéomiques à divers projets, de la conception de l'étude, de la préparation des échantillons, des analyses LC-MSMS, du traitement et de l'interprétation des données, ainsi que de la présentation des résultats protéomiques. Vous travaillerez dans un environnement pluridisciplinaire. Nous recherchons un(e) candidat(e) motivé(e) et dynamique, doté(e) de solides compétences techniques et organisationnelles, ainsi que d'un fort esprit de collaboration.

Responsabilités :

- Définir, planifier et réaliser des expériences : préparation des échantillons, paramétrage des méthodes LC-MS/MS pour l'acquisition de données, traitement et interprétation des données avec validation des résultats
- Organiser et gérer les données de recherche à l'aide d'un cahier de laboratoire électronique
- Respecter les délais, faire preuve d'initiative scientifique en révisant et en adaptant les expériences en fonction des demandes et des résultats attendus
- Être responsable de la gestion des équipements (mise en oeuvre, maintenance, suivi des procédures)
- Proposer et mettre en oeuvre de nouvelles technologies/méthodologies innovantes, améliorant les workflows protéomiques actuels et le débit via l'automatisation
- Communiquer les résultats, rendre compte de votre activité et participer à l'alignement des activités expérimentales et des besoins des projets
- Contribuer aux tâches organisationnelles générales du laboratoire, telles que l'inventaire des consommables, le contrôle fonctionnel des équipements, etc.
- Contribuer au partage d'informations et à la communication au sein de l'équipe analytique ainsi que des différents groupes interdisciplinaires axés sur les projets.

Profil

- Doctorat en chimie analytique ou biochimie, spécialisé(e) dans l'analyse des protéines et des peptides par spectrométrie de masse.
- Vous avez une expérience professionnelle initiale significative en protéomique, idéalement appliquée dans le domaine de l'approche de biologie des systèmes pour analyser la dynamique des protéines dans les systèmes vivants.
- Expérience dans la préparation d'échantillons pour les approches protéomiques, y compris la fractionnement subcellulaire, l'extraction et la purification des protéines, le dosage, l'enrichissement et les techniques de séparation des protéines, l'optimisation de la digestion enzymatique, la désalinisation, le fractionnement et l'enrichissement des peptides si nécessaire.
- Expérience dans l'utilisation de spectromètres de masse haute résolution (en particulier les instruments Thermo Orbitrap) pour définir des méthodes d'acquisition adaptées.
- Familiarité avec les logiciels et outils de protéomique pour les analyses non ciblées (Proteome Discoverer, logiciel Peaks) et ciblées (Skyline), ainsi qu'avec d'autres outils bioinformatiques et bases de données. Expérience à la fois en protéomique qualitative et quantitative.
- Familiarité avec les outils liés à la gestion, à la validation et à l'interprétation des données, avec un résumé des principales conclusions.
- Bonnes compétences en communication et rédaction, notamment en anglais.
- Bonne connaissance générale de la chimie organique et de la biochimie.