Stage Evaluation Terrain d'Un Dispositif de Phénotypage Stomatique Rapide pour l'Agronomie de Précision - 5 à H/F Arvalis

Contexte

ARVALIS - Institut du végétal est un organisme de recherche appliquée en pointe sur l'analyse de données capteurs pour l'agriculture. Au sein du partenariat AgroPhotonique avec Photonics-Bretagne, ARVALIS développe ou adapte des instrument pour la mesure de plein champs des caractères phénotypiques ou physiologiques des couvert de grande culture.

Dans un contexte de dérèglement climatique et de variabilité accrue des stress abiotiques, le suivi du fonctionnement stomatique des plantes en conditions réelles devient un enjeu majeur pour l'agronomie. Les stomates, en régulant les échanges gazeux, jouent un rôle clé dans l'efficacité d'utilisation de l'eau et du carbone. Mieux les caractériser au champ, c'est ouvrir la voie `a de nouvelles stratégies de sélection variétale et de conduite culturale plus résilientes.

Le projet MicroStomate s'inscrit dans cette dynamique. Il vise `a explorer les potentialités d'un phénotypage stomatique rapide, robuste et ergonomique, directement utilisable par les techniciens en réseau d'essais. Ce stage contribuera à cette ambition en évaluant la méthode FieldDino, une approche innovante combinant microscopie portable, porométrie et analyse automatisée par deep learning.

Le stage se déroulera dans un environnement d'excellence, au croisement de la photonique et de l'agronomie de précision. L'équipe AgroPhotonique, fruit d'un partenariat entre ARVALIS et Photonics Bretagne, développe depuis 2018 des solutions innovantes pour le phénotypage de plein champ.
Le/la stagiaire bénéficiera d'un encadrement pluridisciplinaire et de l'appui d'un réseau d'acteurs industriels et techniques bretons impliqués dans le comité de suivi du stage. La figure 1 illustre les mesure exploratoire obtenues dans un stage précédent.

Objectifs du stage et travaux à réaliser

Intégré(e) à l'équipe AgroPhotonique, le/la stagiaire aura pour mission de :

- Reproduire et documenter le montage expérimental FieldDino (microscope portable, clip feuille, app Python, poromètre LI-600) `a partir des ressources open source disponibles.
- Tester et valider la méthode sur des couverts végétaux d'intérêt agronomique en conditions contrôlées puis en plein champ.
- Analyser de manière critique les performances techniques (temps de mesure, robustesse, qualité des images, fiabilité des mesures) et les limites de la méthode dans un contexte d'usage opérationnel.
- Proposer des pistes d'amélioration (ergonomie, automatisation, robustesse) ou un cahier des charges fonctionnel pour un futur instrument de terrain répondant au modèle d'usage : 1 main, 1 bouton, 1 seconde, 1 bip, 2 chiffres.

Selon l'avancement des travaux, des déplacements ponctuels en Bretagne sont à prévoir pour des campagnes de mesures en réseau d'essais.

Ressources

- Matériel en ligne (Bibliographie et dépôt Github)
- Moyens numériques et de prototypage mécanique
- Composants Photonique
- Environnement de tests terrain

Profil

- Etudiant(e) en école d'ingénieur (3e année) ou master 2, avec des compétences en instrumentation, traitement d'image ou analyse de données.
- Des connaissances en physiologie végétale ou expérimentation agronomique sont un plus.
- Curiosité, rigueur, autonomie et goût pour le travail de terrain sont attendus.