Ingénieur pour l'Application des Protéines d'Échafaudage d'Usine Virale à la Biotechnologie H/F CNRS

Le projet principal de l'ingénieur (H/F) consistera à étudier la possibilité d'utiliser des protéines d'échafaudage de virus géants pour optimiser la transcription in vitro.
De plus, l'ingénieur (H/F) participera à un projet en cours visant à générer un criblage à l'échelle du génome des mimivirus.
Activités
PCR, clonage et génération de virus recombinants.
Production et purification de protéines recombinantes
Transcription in vitro
Analyse de l'ARNm
Compétences
Compétences en biologie moléculaire. Compétences en microbiologie. Le conseil et les contacts avec l'industrie seront particulièrement appréciés.

Contexte de travail

Le laboratoire IGS est pionnier et leader mondial dans l'étude des virus géants dont nous avons découvert les quatre familles connues. Une force unique du laboratoire IGS est la coexistence d'une équipe de bioinformatique et d'une équipe de biologie expérimentale, permettant une continuité efficace et transparente depuis l'isolement de nouveaux micro-organismes jusqu'à leur caractérisation complète par la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la génétique inverse. Le laboratoire a également la capacité de déterminer la structure 3D de protéines virales d'intérêt spécifique en utilisant la cristallographie aux rayons X ou en combinaison avec la microscopie électronique.
IGS Resources
Le laboratoire IGS est déjà bien équipé pour la biologie cellulaire (2 salles L2, 6 PSM, 3 microscopes à fluorescence (dont 1 Zeiss Axio), 4 incubateurs), la biochimie (PCR, 1 PSM Microbiologie, 3 incubateurs, 1 Aktä explorer 10S, 1 Aktä 3D, 2 Aktä Prime, Nanodrop, Qubit, spectrophotomètres 96 puits et 1 mL) et biologie structurale (robot de cristallisation Mosquito, diffractomètre maison (diffraction Oxford Xcalibur PXUltra, un speedvac SPD131 ThermoFischer).
L'IGS a un accès direct aux 12 plateaux techniques de l'Institut Méditerranéen de Microbiologie (IMM, AMU-CNRS FR3479, Effectifs : 300). Les plateformes d'intérêt pour le projet sont l'imagerie fluorescence/TEM (TEM, Cryo-TEM), RMN (600 MHz, cryosonde), Protéomique. , installation d'expression et d'interactions protéiques (1 Aktä prime, 1 Aktä Pure). La plateforme de production de protéines exploite un système Blitz permettant de cribler et de caractériser rapidement les interactions macromoléculaires. L'IGS dispose également d'un accès permanent aux plateformes d'imagerie du campus de Luminy, dont la microscopie électronique (. TEM et STEM) à l'IBDM (Institut de Biologie du Développement de Marseille). L'IGS maîtrise toutes les compétences requises en biologie cellulaire (microscopie optique, de fluorescence et électronique, purification des virus, infections synchronisées, extraction et études moléculaires), en biologie structurale, en biochimie et en méthodes de virologie. Le laboratoire fait également partie du BAG du synchrotron de Marseille et a accès aux installations européennes de rayonnement synchrotron et de Soleil pour la cristallographie. Le Bag donne également accès gratuitement aux plateformes EM de l'ESRF équipées du microscope cryoélectronique Titan Krios avec détecteur d'électrons direct K2 Summit, d'un filtre d'imagerie Quantum LS et d'une plaque de phase Volta (VPP). Ce microscope fonctionnera comme une ligne de lumière (CM01) au sein du Partenariat pour la biologie structurale (PSB) avec les microscopes situés à l'IBS et à l'EMBL. L'acquisition des données Cryo-EM sera réalisée en collaboration avec le laboratoire Kay Grünewald, CSSB, Hambourg, Allemagne équipé de cinq cryomicroscopes électroniques, dont 2 Titan-Krios (300 keV top end, autoloader, DED, filtre énergétique, VPP) . Le laboratoire IGS possède toute la puissance de calcul nécessaire (cluster de 71Nodes, 156 CPU, 828 Cores, 4700 Go, 150 To).

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Le laboratoire IGS est pionnier et leader mondial dans l'étude des virus géants dont nous avons découvert les quatre familles connues. Une force unique du laboratoire IGS est la coexistence d'une équipe de bioinformatique et d'une équipe de biologie expérimentale, permettant une continuité efficace et transparente depuis l'isolement de nouveaux micro-organismes jusqu'à leur caractérisation complète par la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la génétique inverse. Le laboratoire a également la capacité de déterminer la structure 3D de protéines virales d'intérêt spécifique en utilisant la cristallographie aux rayons X ou en combinaison avec la microscopie électronique.
IGS Resources
Le laboratoire IGS est déjà bien équipé pour la biologie cellulaire (2 salles L2, 6 PSM, 3 microscopes à fluorescence (dont 1 Zeiss Axio), 4 incubateurs), la biochimie (PCR, 1 PSM Microbiologie, 3 incubateurs, 1 Aktä explorer 10S, 1 Aktä 3D, 2 Aktä Prime, Nanodrop, Qubit, spectrophotomètres 96 puits et 1 mL) et biologie structurale (robot de cristallisation Mosquito, diffractomètre maison (diffraction Oxford Xcalibur PXUltra, un speedvac SPD131 ThermoFischer).
L'IGS a un accès direct aux 12 plateaux techniques de l'Institut Méditerranéen de Microbiologie (IMM, AMU-CNRS FR3479, Effectifs : 300). Les plateformes d'intérêt pour le projet sont l'imagerie fluorescence/TEM (TEM, Cryo-TEM), RMN (600 MHz, cryosonde), Protéomique. , installation d'expression et d'interactions protéiques (1 Aktä prime, 1 Aktä Pure). La plateforme de production de protéines exploite un système Blitz permettant de cribler et de caractériser rapidement les interactions macromoléculaires. L'IGS dispose également d'un accès permanent aux plateformes d'imagerie du campus de Luminy, dont la microscopie électronique (. TEM et STEM) à l'IBDM (Institut de Biologie du Développement de Marseille). L'IGS maîtrise toutes les compétences requises en biologie cellulaire (microscopie optique, de fluorescence et électronique, purification des virus, infections synchronisées, extraction et études moléculaires), en biologie structurale, en biochimie et en méthodes de virologie. Le laboratoire fait également partie du BAG du synchrotron de Marseille et a accès aux installations européennes de rayonnement synchrotron et de Soleil pour la cristallographie. Le Bag donne également accès gratuitement aux plateformes EM de l'ESRF équipées du microscope cryoélectronique Titan Krios avec détecteur d'électrons direct K2 Summit, d'un filtre d'imagerie Quantum LS et d'une plaque de phase Volta (VPP). Ce microscope fonctionnera comme une ligne de lumière (CM01) au sein du Partenariat pour la biologie structurale (PSB) avec les microscopes situés à l'IBS et à l'EMBL. L'acquisition des données Cryo-EM sera réalisée en collaboration avec le laboratoire Kay Grünewald, CSSB, Hambourg, Allemagne équipé de cinq cryomicroscopes électroniques, dont 2 Titan-Krios (300 keV top end, autoloader, DED, filtre énergétique, VPP) . Le laboratoire IGS possède toute la puissance de calcul nécessaire (cluster de 71Nodes, 156 CPU, 828 Cores, 4700 Go, 150 To).

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques

Pour postuler au poste à l'IGS, le candidat doit envoyer son CV avec une liste complète des publications, une lettre de motivation.
Pour postuler au poste à l'IGS, le candidat doit envoyer son CV avec une liste complète des publications, une lettre de motivation.