Chargé d'Etudes H/F Institut Gustave Roussy
Villejuif - 94 CDD- 35 000 € / an
- 1 an
- Bac +5
- Service public des collectivités territoriales
- Exp. 1 à 7 ans
Détail du poste
Premier centre européen de lutte contre le cancer et classé au troisième rang mondial des hôpitaux en cancérologie, Gustave Roussy est un institut de soins, de recherche et d'enseignement, qui prend en charge des patients atteints de tout type de cancer, à tout âge de la vie. Son expertise des cancers rares et des tumeurs complexes est internationalement reconnue.
Nous recherchons au sein du programme Interception de Gustave Roussy qui se consacre à la détection très précoce et à la prévention des cancers, un(e) Chargé(e) d'Etudes en CDD d'un an.
Au sein de ce cadre, le Laboratoire de Recherche Translationnelle (I-TRL) développe des outils moléculaires de pointe - du séquençage long read aux omiques spatiales - afin d' « intercepter » la transformation maligne à ses premiers stades.
La personne recrutée consacrera environ 80 % de son temps au projet STILL (Spatial Transcriptomics on Invasive vs Localised Lesions), un programme multi-cancer qui cartographie le passage des lésions in situ à l'invasion grâce au GeoMx Digital Spatial Profiler et à un shallow whole-genome sequencing associé, et 20 % pour aider aux autres tâches du laboratoire.
Missions principales
- Réaliser les colorations H&E/IF et collaborer avec les pathologistes pour annoter les régions d'intérêt (ROIs) ;
- Piloter le GeoMx DSP : programmation des ROIs, clivage UV, collecte des oligonucléotides et QC initial ;
- Collaborer avec l'Unité de Génomique pour la préparation des librairies NGS (atlas transcriptomique complet & WGS low-input) et la planification des runs ;
- Participer à la microdissection laser de coupes sériées pour l'extraction d'ADN ;
- Tenir à jour les SOP, les stocks de réactifs et le parc d'équipements ; contribuer aux registres qualité ;
- Assurer l'interface avec les bioinformaticien(ne)s pour la traçabilité et l'intégrité des données.
Livrables attendus
- Jeux de données spatial-omics et WGS de haute qualité livrée dans les délais prévus ;
- Cahier de laboratoire électronique, suivi des réactifs et des équipements à jour ;
- Mises à jour écrites des SOP et rapports de résolution de problèmes.
Profil recherché
- Diplôme : Master (Bac +5) en biologie moléculaire, génomique ou ingénierie biomédicale.
- Compétences techniques : préparation de tissus, extraction ARN/ADN, préparation de librairies NGS ; une première expérience en transcriptomique spatiale (GeoMx, Visium, MERFISH.) ou en LCM est un atout.
- Qualités personnelles : rigueur, autonomie, esprit d'équipe, sens de l'initiative, anglais courant (les réunions du laboratoire se tiennent en anglais).
- Bonus : connaissance des métriques QC FFPE, pathologie numérique ou bases de scripting bioinformatique
- Langues : anglais courant indispensable.
Contrat & avantages
- Type : CDD 1 an, temps plein, possibilité de prolonger
- Date de début : dès que possible (flexible, T3 2025)
- Lieu : sur site à Gustave Roussy (Villejuif, île-de-France)
- Accès à une plateforme d'omics spatiales de pointe, aux plateaux techniques du campus et à des programmes de formation internes
L'adresse du poste
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Le profil recherché
Experience : 2 An(s)
Qualification : Agent de maîtrise
Secteur d'activité : Activités hospitalières
- Villejuif - 94
- CDD
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