Ingénieur de Recherche en Écologie Moléculaire et Analyse de Données Adne H/F CNRS

Description du Poste Les Missions La personne exercera son activité au CNRS, à l'IRBI, dans le cadre du projet DYNABIOD qui ambitionne de comprendre comment plantes et invertébrés sont affectés par les activités humaines et les changements environnementaux, afin d'agir plus vite et de manière plus juste pour la conservation des espèces et la préservation des bénéfices de leurs rôles écosystémiques. Les objectifs spécifiques de ce poste sont d'évaluer la faisabilité et les limites de l'ADN environnemental digestif pour reconstruire les réseaux d'interactions trophiques. Le travail se concentrera sur la description du régime alimentaire des carabes. Une part important du travail sera également consacrée à la conception et la mise à l'épreuve d'amorces PCR bloquantes spécifiques aux Carabidae, afin d'optimiser la détection des séquences de proies. Ce travail s'inscrit à la suite d'une thèse dédiée à l'impact des changements de pratiques agricoles (30 dernières années) sur les régimes alimentaires des carabes et les communautés d'invertébrés du sol.Présentation de l'équipe : La/le chercheur.se intégrera l'équipe IMIP : Interactions Microorganismes Insectes Plantes de l'IRBI, travaillera en collaboration avec les participants académiques du projet DYNABIOD et pourra participer à l'encadrement d'étudiants. L'Activité La personne recrutée sur ce poste aura comme tâche d'organiser la collecte et le stockage d'échantillons en provenance des collections du Centre Biologique de Chizé et potentiellement d'autres sources. De réaliser les analyses moléculaires en amont du séquençage NGS. Les tâches incluront donc la dissection des insectes en conditions stériles, l'extraction d'ADN à partir du contenu des tubes digestifs, l'amplification par PCR de l'ADN des proies et la préparation des librairies NGS pour le séquençage sur plateforme illumina. La personne recrutée travaillera également à l'analyse statistique des données qui seront produites par les bio-informaticiens du projet DYNABIOD. De nouveau échantillons seront également collectés sur le terrain au printemps et été 2027. Des déplacements sur les sites de collecte seront donc organisées, notamment dans la Zone Atelier Plaine et Val de Sèvres, mais aussi dans des parcelles agricoles en Région Centre. Il est attendu de cette personne qu'elle soit moteur dans la production d'articles scientifiques et la diffusion des résultats. Elle participera aussi activement à la vie de l'équipe IMIP aussi bien sur le plan scientifique qu'organisationnel. Votre Profil Compétences Le·a candidat·e sera titulaire d'un doctorat en biologie, doté·e de solides compétences en entomologie, notamment en taxonomie et dissection d'insectes, ainsi qu'en biologie moléculaire, avec une expertise avérée en métabarcoding ADN (incluant l'extraction d'ADN environnemental, l'amplification pas PCR, la préparation de librairies NGS). La maîtrise des statistiques descriptives et multivariées sous R est également requise afin d'analyser les données produites.Une expérience de terrain en entomologie sera particulièrement appréciée. Enfin, le·a candidat·e devra être titulaire du permis B et justifier d'un niveau d'anglais C1 pour évoluer dans un environnement scientifique international. Votre Environnement de Travail L'Institut de Recherche sur la Biologie de l'Insecte (IRBI) se consacre à l'analyse des interactions entre les insectes et leur environnement biotique et abiotique. L'IRBI est doté d'une force vive et dynamique de 27 chercheurs/enseignants-chercheurs permanents. L'institut s'appuie également sur les compétences de nombreux post doctorants et chercheurs contractuels ainsi que 18 doctorants pour un effectif global de 75 personnes. L'IRBI organise de façon régulière des séminaires scientifiques sur de thèmes variés liés aux insectes. Rémunération et avantages Rémunération 3143,64 et 3403,43 euros brut mensuel selon expérience Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR7261-AICBEL-053 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche