Gestionnaire de Données Biomédicales - 50% Rhu Envisage & 50% Pole Cardio Thoracique H/F

CHU Bordeaux

Le CHU de Bordeaux recrute un(e) Gestionnaire de données biomédicales (Data-manager) au sein du Centre d'Investigation Clinique (CIC) Cardiovasculaire, sur le site de l'Hôpital Haut-Lévêque.

Le poste est réparti entre deux activités, représentant chacune 50 % du temps de travail (ETP):

- Activité dédiée au RHU ENVISAGE

Le RHU ENVISAGE (ENhanced Valves Interventions and Safe AI Generated End results) est un projet de Recherche Hospitalo-Universitaire d'envergure internationale, porté par le Pr Thomas Modine, responsable scientifique et technique, et l'équipe clinique de l'Unité Médico-chirurgicale des Valvulopathies (UMCV). Lauréat du sixième appel à projets RHU, il vise à développer des solutions innovantes d'intelligence artificielle appliquées à la prise en charge des valvulopathies cardiaques.

L'UMCV réunit, au sein d'une même structure, des expertises en imagerie cardiovasculaire, cardiologie interventionnelle et chirurgie cardiaque. Le projet ENVISAGE s'appuie sur une approche pluridisciplinaire associant des compétences en gestion des données, intelligence artificielle, traitement et analyse d'images médicales, ainsi qu'en planification des procédures transcathéter. Il mobilise un réseau de partenaires académiques, industriels et de centres cliniques nationaux et internationaux.

Dans ce contexte, le(la) gestionnaire de données biomédicales (data-manager) assure le regroupement des données cliniques transmises par les centres partenaires nationaux et internationaux, leur intégration dans l'e-CRF du projet ainsi que leur contrôle qualité, de leur cohérence et de leur conformité, afin de garantir leur exploitation pour les analyses statistiques. Il(elle) sera en lien étroit avec l'équipe coordinatrice du RHU ENVISAGE dont le biostatisticien et la chargée d'études.

- Activité transversale au sein du CIC Cardiovasculaire

Cette activité s'inscrit dans le cadre du plan de soutien à la recherche des axes HÉRES du CHU de Bordeaux.

L'axe Cardiovasculaire du pôle cardio-thoracique (PCT) regroupe les activités de recherche clinique des services de valvulopathies et cardiomyopathies, chirurgie cardiaque adulte et congénitale, cardiologie interventionnelle structurelle, maladies cardiovasculaires congénitales, maladies coronaires et vasculaires, insuffisance cardiaque, hypertension artérielle, ainsi que rythmologie et stimulation cardiaque.

Dans ce cadre, le(la) data-manager accompagne les médecins, les internes, et travaille en collaboration avec le biostatisticien et la chargée d'études du PCT, dans la préparation des bases de données destinées aux analyses statistiques, aux travaux universitaires et aux publications scientifiques. Il participe au contrôle qualité, au nettoyage, à la structuration et à l'extraction des données afin de produire des jeux de données fiables et exploitables.

Il(elle) contribue également à la mise en conformité et à la structuration des bases de données de soins sous REDCap, en lien avec les démarches réglementaires en vigueur, afin de favoriser leur sécurisation, leur pérennisation et leur réutilisation à des fins de recherche.

Mission générale :

Le(la) gestionnaire de données biomédicales (data-manager) assure le regroupement, la structuration, le traitement et la valorisation des données de santé utilisées dans la cadre du RHU ENVISAGE et des projets de recherche à thématique cardiovasculaire menés au sein du pôle cardio-thoracique.

Il(elle) conçoit, développe, maintient et sécurise les bases de données de recherche, contrôle la qualité, la cohérence et la conformité des données collectées, puis prépare des jeux de données fiables et exploitables en vue des analyses statistiques, des travaux universitaires et des publications scientifiques. À ce titre, il(elle) accompagne les cliniciens, les internes et travaille avec le biostatisticien dans la préparation, le contrôle qualité et le nettoyage des bases de données afin de garantir leur exploitation pour les analyses statistiques et la valorisation scientifique.

Il(elle) participe à la conception et à la maintenance des e-CRF et des bases de données sous REDCap, réalise les extractions de données nécessaires aux projets de recherche et met en oeuvre les procédures de gestion des données et de contrôle qualité, dans le respect des exigences réglementaires.

Il(elle) exerce ses missions en étroite collaboration avec l'équipe coordinatrice du RHU ENVISAGE ainsi qu'avec les investigateurs, les internes, le biostatisticien, la chargée d'études et les équipes de recherche du CIC Cardiovasculaire et de rythmologie.

Principales activités:

• Gestion des données
  • Participer à l'élaboration des jeux de données en s'assurant de leur conformité et de leur adéquation aux besoins des projets.

Pour le RHU ENVISAGE, assurer la migration des données des centres partenaires vers l'e-CRF du projet.

Pour les autres projets à thématique cardiovasculaire, préparer les jeux de données répondant aux besoins des cliniciens et des analyses statistiques.

• • Concevoir et automatiser des contrôles de cohérence et d'intégrité des données
  • Rédiger les requêtes d'extraction des données nécessaires à l'exploitation des données dans le cadre des études et des analyses statistiques.
  • Rédiger les requêtes d'extraction et le croisement des données issues de différentes sources (EDS, bases de soins)
  • Concevoir et gérer les bases de données multi-dimensionnelles
  • Réaliser le screening des patients pour les projets des services et les études de faisabilité
  • Contribuer à la révision, à la mise à jour et à la validation des documents de gestion des données (plan de gestion des données, plan de validation des données), en lien avec la chargée d'études et le biostatisticien du RHU et du PCT.

• Développement informatique

• • Développer et valider les eCRF sous REDCap pour les besoins du RHU ENVISAGE et des études/bases de données à thématique cardiovasculaire.
  • Participer à l'élaboration de scripts permettant la migration et l'automatisation des données issues des centres partenaires du RHU ENVISAGE, de l'entrepôt de données de santé (EDS) ou des bases de données existantes, vers les eCRF sous REDCap.
  • Accompagner les équipes dans l'utilisation de l'entrepôt de données de santé (EDS).
  • Gérer et optimiser les bases de données à visée de recherche existantes, notamment à l'aide du langage Python.

• Veille informatique
  • Réaliser une veille technique et réglementaire relative à son domaine d'activité
  • Fournir un support technique aux membres de l'équipe recherche sur les outils de gestion des données et les meilleures pratiques en matière de qualité des données
  • Rédiger des documents techniques relatifs à la gestion des données.