Thèse Implication de Hlyf dans le Franchissement des Barrières Épithéliales et Endothéliales des Escherichia Coli Pathogènes. H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Toulouse École doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies Laboratoire de recherche : IRSD - Institut de Recherche en Santé Digestive Direction de la thèse : Priscilla BRANCHU ORCID 0000000281271181 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-01T23:59:59 Les Escherichia coli associés aux méningites néonatales (NMEC) et les E. coli pathogènes aviaires (APEC) constituent deux sous-groupes apparentés d'E. coli pathogènes extra-intestinaux (ExPEC). Ces bactéries représentent un enjeu majeur pour la santé humaine et les élevages avicoles en raison de leur potentiel zoonotique et de l'émergence croissante de souches multirésistantes aux antibiotiques. Une meilleure compréhension des mécanismes impliqués dans leur virulence est donc indispensable au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques alternatives.
Nos travaux ont montré que le gène hlyF constitue un facteur de virulence clé dans la pathogénicité des APEC et des NMEC. L'expression de hlyF favorise notamment la production de vésicules de membrane externe (VME), capables de bloquer le flux autophagique et d'exacerber les réponses inflammatoires des cellules eucaryotes cibles. Des résultats préliminaires obtenus au laboratoire montrent également que les VME produites par les souches exprimant hlyF altèrent l'intégrité des barrières épithéliales et endothéliales de l'hôte. Cette déstabilisation pourrait favoriser la translocation bactérienne et constituer une étape clé dans l'initiation et/ou l'aggravation des pathologies associées aux APEC et aux NMEC.
L'objectif principal de cette thèse sera d'évaluer le rôle de HlyF dans le passage des APEC et des NMEC à travers les barrières épithéliales et endothéliales. Pour cela, le doctorant développera et exploitera différents modèles cellulaires in vitro reproduisant ces barrières biologiques.
Dans un premier axe, l'étudiant mettra en place des modèles de barrières épithéliales à partir de lignées cellulaires pulmonaires de poulet afin d'étudier si la désorganisation de l'épithélium induite par les VME favorise la translocation des souches APEC.
Dans un second axe, le doctorant développera un modèle de barrière endothéliale mimant la barrière hémato-encéphalique, grâce à une collaboration déjà établie avec une équipe spécialiste de cette barrière. Ce modèle permettra d'évaluer le rôle de HlyF et des VME dans le franchissement endothélial des souches NMEC.
Ce projet de thèse combinera microbiologie, biologie cellulaire et étude des interactions hôte-pathogène afin de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans la virulence zoonotique des ExPEC et d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles. Le projet s'inscrit dans une démarche globale d'une meilleure compréhension des facteurs de virulence bactériens dans la translocation des Escherichia coli pathogènes au travers des barrières de l'hôte. Les méthodes utilisées seront principalement de la biologie moléculaire, de la microbiologie, de la culture cellulaire ainsi que des techniques de biochimie.