Détail du poste
Contexte du recrutement et définition de poste
Contexte : Le déclin des populations et des espèces d'insectes est une conséquence majeure de la crise de la biodiversité. Ce déclin a notamment un impact majeur sur les pollinisateurs et sur le service de pollinisation, indispensable à la reproduction de nombreuses espèces végétales, sauvages et cultivées.
La mesure de ce déclin et l'évaluation de l'efficacité des mesures prises pour l'atténuer et l'inverser nécessitent de connaître et de suivre les dynamiques temporelles et spatiales de ces insectes. Pour cela, il faut être en mesure d'identifier rigoureusement les très nombreuses espèces impliquées dans la pollinisation et d'en caractériser la composition des communautés sur le territoire français.
Dans le cadre du volet connaissance du Plan national en faveur des insectes pollinisateurs et de la pollinisation, des efforts particuliers sont dédiés à la compilation de données génétiques permettant l'identification et la délimitation des espèces. Ces séquences ADN, comme les codes-barres ADN standardisés, permettent en effet une identification rigoureuse d'un individu inconnu, ou même de communautés entières par des approches de métagénomique (analyses d'ADN environnemental ou metabarcoding de communautés). Ces approches permettent l'identification des espèces sans posséder d'expertise taxonomique, mais celle-ci demeure fondamentale pour la construction de librairies de séquences de référence robustes et complètes, indispensables au fonctionnement de ces outils.
Ce poste s'inscrit dans le cadre de la contribution du Muséum national d'Histoire naturelle à ce volet connaissance par la production et la compilation de séquences ADN de référence pour l'identification des espèces d'insectes pollinisateurs de France hexagonale et des DROM-COM.
Les missions :
La personne recrutée aura pour missions :
· La curation et la valorisation des données déjà existantes
- Analyser, compléter, corriger les données génétiques et les métadonnées associées qui sont déjà déposées dans le Barcode of Life Datasystems (BOLD) ;
- Animation scientifique auprès d'un réseau de collaborateurs et d'experts (ex. CODABEILLES, sociétés entomologiques : Oreina, communauté Syrph the net...) pour impliquer les experts dans l'identification de spécimens ;
- Assemblage de jeux de données (taxonomiques ou régionaux) et publications d'articles de données ;
- Liens et transferts de données avec le référentiel GenRef pour la diffusion de jeux de données validés.
· La conception et la mise en oeuvre d'une stratégie d'échantillonnage pour combler les lacunes de couverture des librairies de référence existantes
Avec pour guide les résultats de l'analyse de lacunes réalisée dans le cadre de GenRef :
- Mobilisation de réseaux existants (entomologistes/naturalistes, FRBOL), de collections (Recolnat, sociétés entomologiques), ou encore d'échantillons déjà collectés au MNHN dans le cadre du projet BIOSCAN-FR (pièges Malaise) ;
- Organiser et participer à des missions d'échantillonnage ponctuelles (sur le terrain ou dans des collections, ciblées géographiquement ou taxonomiquement) ;
La personne recrutée pourra s'appuyer sur les flux de travail et les activités du réseau FRBOL qui partage ces mêmes missions avec pour cible l'ensemble de la diversité eucaryote française. Elle pourra également s'appuyer sur les ressources du projet BIOSCAN-FR qui déploie sur le territoire des dispositifs de surveillance de la diversité des insectes (pièges Malaise traités par metabarcoding) mais aussi - au travers de collaborations - sur d'autres projets et programmes en cours et dont les objectifs convergent, comme le référentiel national de séquences génétiques (GenRef) ou encore le programme national Dynabiod (PEPR) co-porté par le MNHN.
Les indicateurs d'évaluation et les livrables attendus :
Ce travail devra permettre une hausse de la couverture des librairies de référence (mesurable via les résultats de l'analyse des lacunes et leur actualisation) pour les insectes pollinisateurs de France, une meilleure fiabilité des données et des métadonnées de ces librairies, et leur meilleure diffusion selon les principes FAIR (par ex. au travers de publications de « data papers », de jeux de données publics dans des bases de données internationales (BOLD, GenBank) et dans le référentiel national (GenRef).
Profil recherché
La/le candidat(e) recherché(e) devra être titulaire d'un diplôme de niveau master ou équivalent en sciences de la biodiversité ; il peut s'agir de formations en écologie ou en biologie évolutive avec une composante dédiée à la systématique ou également d'une formation dédiée à la biologie moléculaire dans un contexte de génétique ou de génomique environnementale.
Connaissances et compétences attendues :
- Théorie et pratique de la taxonomie, notamment moléculaire et appliquée à la caractérisation de la biodiversité (DNA barcoding, ADNe, metabarcoding).
- Expérience dans l'utilisation de bases de données, notamment du Barcode of Life Datasystems (BOLD) et de son architecture de gestion, d'analyse, de curation et de publication des données de barcoding.
- Gestion de données et rigueur dans le traitement des données et leur traçabilité.
- Posséder une fibre naturaliste généraliste forte et des compétences taxonomiques avérées en entomologie et idéalement pour un ou des groupes d'insectes pollinisateurs.
Compétences complémentaires :
- Démontrer de très bonnes qualités relationnelles au travers d'une expérience avérée d'animation scientifique fondée sur des interactions avec des collaborateurs ou des acteurs de terrain : appropriation d'objectifs collectifs et mobilisation, transmission de bonnes pratiques (formation, accompagnement).
Posséder d'excellentes aptitudes de communication écrites et orales pour échanger avec les membres du réseau, à la fois collectivement (liste de diffusion, site internet) et individuellement.
Information(s) complémentaire(s)
Venez rejoindre un établissement chargé d'histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d'une grande variété de métiers et d'activités, le Muséum vous propose d'intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.
Le contrat
Localisation : Jardin des plantes
Contrat : Contrat de projet
Temps de travail : 35h35 par semaine et 44 jours de congés annuels.
Les avantages
Remboursement de 75% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)
Télétravail possible après 4 mois d'ancienneté (de 1 ou 2 jours selon les fonctions, activités, service et contexte de travail)
Restaurant d'entreprise
Mutuelle d'établissement
Un comité social et une association sportive et culturelle
Accès illimité aux sites de l'établissement avec invités
Publiée le 12/05/2026 - Réf : fb21e6a8d7d531cbc73b55ad4a5ed2c2
