Détail du poste
Établissement : Université d'Angers École doctorale : École doctorale Biologie Santé Laboratoire de recherche : Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Intégrée Nantes Angers Direction de la thèse : Yves DELNESTE Date limite de candidature : 2026-05-22T00:00:00 Résumé L'équipe s'intéresse aux dysfonctions cellulaires associées aux pathologies sévères (cancer, inflammation chronique), avec un focus sur les mécanismes responsables des altérations induites par un stress cellulaire, dans le but d'identifier des stratégies permettant de restaurer les fonctions cellulaires. L'équipe a ainsi montré que le corps cétonique acétoacétate (AcAc), un métabolite endogène, protège les cellules exposées à un stress aigu ( Nat Commun . 2021). Les données récentes indiquent que ce potentiel cytoprotecteur repose sur la modulation de plusieurs processus intracellulaires qui interviennent à différents niveaux de la biologie des cellules ( régulations métaboliques, épigénétiques, transciptionnelles et post-traductionnelles) L'objectif du projet sera de proposer une cartographie des processus moléculaires régulés par l'AcAc, en définissant (i) comment les modifications des flux métaboliques induits par l'AcAc contrôlent les équilibres redox et le fonctionnement mitochondrial (mesure du métabolisme cellulaire par SeaHorse ; fluxomique par 13C tracing) et (ii) en évaluant la modulation des mécanismes épigénétiques (ChIP-Seq, snChip-Seq, ATAC-Seq) et transcriptomiques (bulk et scRNA-Seq) ainsi que des modifications post-traductionnelles (spectrométrie, Western blooting). Ces expériences seront réalisées in vitro en utilisant des cellules isolées de sujets sains exposées à différents types de stress (comme l'hypoxie) ou ex vivo à partir de cellules circulantes isolées de patients (sepsis, infarctus). Le rôle des principales voies de protection identifiées sera validé d'abord in vitro par des approches d'extinction de l'expression des molécules identifiées puis in vivo dans des modèles de stress tissulaire et reposera sur des approches d'analyse à l'échelle unicellulaire (scRNA-Seq) et tissulaire (imagerie fonctionnelle ; transcriptomique). Ces modèles permettront également de (i) définir des signatures sériques (protéiques et/ou métaboliques) associées à la protection tissulaire apportée par l'AcAc et (i) de modéliser le métabolisme de l'AcAc dans un organisme exposé à un stress tissulaire.
Le projet sera réalisé dans le cadre d'un projet ANR. Le.la candidat.e bénéficiera de l'ensemble des moyens techniques et technologiques de l'équipe et des plateformes de la SFR
Enjeux du projet.
Ce projet vise à décrypter les mécanismes métaboliques et moléculaires associés au rôle cytoprotecteur de l'AcAc. Il permettra au candidat d'acquérir des compétences multiples en biologie cellulaire (métabolomique/fluxomique ; phénotypage ; profilage fonctionnel), en biologie moléculaire (transcriptomique et épigénétique) et en imagerie.
Publiée le 05/05/2026 - Réf : 40ab1935aeea90f3511d8e5c5e681d4a