Thèse Dissection de la Régulation Transcriptionnelle par les Ilots Cpg H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : IGMM - Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier
Direction de la thèse : Jean-Christophe ANDRAU
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Le(a) doctorant(e) mènera une étude visant à analyser en détail le rôle d'éléments régulateurs essentiels des génomes mammifères, tant au niveau des promoteurs que des enhancers, et appelés îlots CpG (CGIs). Il insérera des versions sauvages et mutées de ces CGIs et évaluera leur capacité à induire l'activation ou la répression de la transcription, ainsi que leur implication dans un marquage épigénétique spécifique et les interactions longue distance. Une attention particulière sera accordée au rôle de structures secondaires de l'ADN appelées « G-quadruplex » dans les propriétés des CGIs. Le projet fera également appel à des approches de biologie synthétique. L'étudiant bénéficiera d'un environnement où sont maîtrisés de nombreux protocoles génomiques ainsi que des procédures bioinformatiques pour analyser les données. Il aura également la possibilité d'acquérir les bases de la bioinformatique grâce à des ateliers spécifiques organisés par l'équipe.

Laboratoire de génomique fonctionnelle spécialiste de la transcription et de la chromatine.

Comprendre et disséquer le fonctionnement d'éléments régulateurs du génome

- Technique de CRISPR pour insetion des éléments modèles.
- Génomique fonctionnelle: ChIP-seq, RNA-seq, Cut and Tag, G4access, MicroC