Thèse Développement et Application d'Outils Informatiques pour la Médecine de Précision H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : CRBM - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier
Direction de la thèse : Andrey KAJAVA ORCID 0000000223426886
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Notre équipe utilise des méthodes de bioinformatique et de biologie computationnelle pour comprendre les principes de la structure des protéines et des interactions biomoléculaires. La bioinformatique joue un rôle de plus en plus important dans la recherche biologique. De plus, la croissance des données de séquençage liées aux informations cliniques jette les bases de l'application de la bioinformatique en médecine de précision. Nos progrès avec une annotation structurale à grande échelle et de haute qualité des protéomes (https://bioinfo.crbm.cnrs.fr/index.php?route=home), combinée à des informations sur les mutations de l'individu, ouvriront une voie pour la
compréhension des maladies héréditaires. En outre, il peut découvrir les raisons moléculaires pour lesquelles les patients peuvent réagir différemment au même médicament. Croiser les informations sur la variabilité des gènes humains et les données issues de notre annotation structurale et fonctionnelle des protéomes sera notre prochain objectif.

Aujourd'hui, le déluge de données biologiques révolutionne les sciences de la vie et la médecine. L'une des principales sources de ces données est le séquençage du génome à haut débit. La croissance spectaculaire des données génomiques pose de nouveaux défis aux scientifiques : donner du sens à des millions de séquences protéiques nécessite des informations sur leur structure tridimensionnelle et leur fonction.

Récemment, l'approche d'apprentissage automatique AlphaFold a permis une avancée majeure dans le domaine de la prédiction de la structure des protéines. En conséquence, la bioinformatique liée à l'analyse des relations entre séquence, structure et fonction des protéines jouera un rôle de plus en plus important dans la recherche biologique.

Parallèlement, la croissance des données de séquençage associées à des informations cliniques constitue une base pour l'application de la bioinformatique à la médecine de précision.