Thèse Rôle des Interactions Métaboliques du Microbiote Intestinal Néonatal dans la Maturation du Système Nerveux Entérique et la Régulation de la Sensibilité Colique H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Clermont Auvergne École doctorale : Sciences de la Vie, Santé, Agronomie, Environnement Laboratoire de recherche : NEURO-DOL Direction de la thèse : FREDERIC CARVALHO ORCID 0000000315922369 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-15T23:59:59 Le microbiote intestinal est aujourd'hui reconnu comme un acteur majeur de la physiologie digestive et de la communication au sein de l'axe microbiote/intestin/cerveau. La période néonatale constitue une étape clé de la colonisation microbienne, durant laquelle l'établissement du microbiote intestinal participe à la maturation de nombreuses fonctions physiologiques, notamment la barrière intestinale, le système immunitaire et le système nerveux entérique (SNE). Des altérations précoces du microbiote ont été associées à une augmentation du risque de troubles fonctionnels digestifs à l'âge adulte, en particulier au développement d'une hypersensibilité viscérale d'origine colique (HSVC) caractéristique du syndrome de l'intestin irritable (SII).
Si la composition du microbiote intestinal a été largement étudiée dans ce contexte, le rôle des interactions métaboliques entre microorganismes, et en particulier les phénomènes de cross-feeding conduisant à la production de métabolites microbiens bioactifs, reste encore peu exploré. Ces interactions métaboliques pourraient pourtant constituer un déterminant majeur de la communication microbiote/hôte en modulant l'activité neuronale entérique, les réponses immunitaires et l'intégrité de la barrière intestinale. La manière dont ces processus influencent la maturation du SNE et la programmation de la sensibilité viscérale d'origine colique au cours de la période néonatale demeure largement inconnue.
L'objectif de ce projet de thèse est de déterminer comment les interactions métaboliques du microbiote intestinal néonatal contribuent à la maturation fonctionnelle du système nerveux entérique et à la régulation de la sensibilité colique. Pour répondre à cette question, le projet combinera des approches expérimentales intégrées incluant des modèles murins à microbiote contrôlé, des analyses de la composition microbienne et des métabolites microbiens, ainsi que des études fonctionnelles du SNE et de la sensibilité colique. L'impact de métabolites microbiens spécifiques issus de ces interactions bactériennes sera notamment évalué sur l'activité neuronale entérique et sur la modulation de la sensibilité viscérale d'origine colique.
Ce travail permettra de mieux comprendre comment les interactions métaboliques du microbiote intestinal au cours des premières étapes de la vie participent à la programmation des circuits neuro-entériques impliqués dans la perception viscérale. En identifiant de nouveaux mécanismes reliant microbiote précoce et HSVC, ce projet pourrait ouvrir la voie au développement de stratégies préventives ou thérapeutiques ciblant le microbiote intestinal dans les troubles fonctionnels digestifs.
Le microbiote intestinal joue un rôle majeur dans la maturation de l'axe microbiote/intestin/cerveau au cours des premières étapes de la vie. La période néonatale constitue une fenêtre critique durant laquelle la colonisation microbienne participe au développement de la barrière intestinale, du système immunitaire et du système nerveux entérique. Des altérations précoces du microbiote ont été associées à un risque accru de troubles fonctionnels digestifs et d'hypersensibilité viscérale à l'âge adulte. Toutefois, le rôle des interactions métaboliques entre microorganismes, notamment les phénomènes de cross-feeding produisant des métabolites bioactifs, reste encore peu exploré dans la programmation précoce de la sensibilité colique. Déterminer comment les interactions métaboliques au sein du microbiote intestinal néonatal influencent la maturation fonctionnelle du système nerveux entérique et la régulation de la sensibilité colique, afin d'identifier les mécanismes reliant microbiote précoce et hypersensibilité viscérale. Le projet reposera sur une approche intégrative combinant des modèles murins à microbiote contrôlé, des analyses de la composition du microbiote intestinal (métagénomique) et des métabolites microbiens (métabolomique). Des approches fonctionnelles permettront d'évaluer la maturation du système nerveux entérique et la sensibilité colique, ainsi que l'impact de métabolites microbiens spécifiques issus des interactions bactériennes sur l'activité neuronale entérique et la sensibilité colique.