Thèse Rôle de Nouveaux Acteurs dans l'Assemblage - Déassemblage de l'Hétérochromatine Péricentrique chez l'Homme H/F

Université Grenoble Alpes

Établissement : Université Grenoble Alpes
École doctorale : CSV- Chimie et Sciences du Vivant
Laboratoire de recherche : IAB : Institute for Advanced Biosciences (UGA / Inserm U1209 / CNRS UMR 5309)
Direction de la thèse : Daphné BERNY ORCID 0000000274369885
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-09T23:59:59

L'hétérochromatine est un état de la chromatine présent chez la grande majorité des eucaryotes (1). Elle se forme principalement au niveau de répétitions d'ADN non codantes (comme dans les régions péricentromériques du génome) et est essentielle à la stabilité du génome ainsi qu'à la réduction au silence à long terme de l'expression génique (communément appelé silencing épigénétique). En conséquence, une dérégulation du maintien de l'hétérochromatine est associée à de nombreuses maladies.
Bien que l'hétérochromatine soit reconnue pour son silencing épigénétique, l'exposition à un stress thermique a la capacité remarquable d'induire, chez l'humain, un réveil transcriptionnel rapide et réversible de régions d'hétérochromatine péricentrique (2). Ce réveil transcriptionnel naturel constitue un modèle unique et puissant pour étudier comment le réveil transcriptionnel de l'hétérochromatine peut être activé de manière contrôlée et réversible de temps, et comment ce processus potentiellement délétère est étroitement régulé pour éviter une forte instabilité génomique.
Le déclencheur initial de ce réveil transcriptionnel est la liaison du facteur de transcription Heat Shock Factor 1 (HSF1), principalement au niveau de l'hétérochromatine péricentrique du chromosome 9, la plus vaste région d'hétérochromatine chez l'humain. La fixation d'HSF1 à cette région active la transcription des répétitions d'ADN non codantes satellite III (SATIII). Cette transcription produit des ARN non codants SATIII qui restent localisés à leur site de production et servent de plateformes pour le recrutement de protéines sur la chromatine. La fonction de plateforme ARN des ARNnc SATIII fait partie de la réponse cellulaire au stress thermique et elle contribue à la reprogrammation de l'expression de centaines de gènes en séquestrant un régulateur clé (3). La question de savoir si ces ARNnc jouent également un rôle dans le maintien de l'hétérochromatine péricentrique du chromosome 9 reste à être testé. Très récemment, nous avons découvert de nouvelles protéines qui se localisent à l'hétérochromatine péricentrique du chromosome 9 lorsqu'elle subit un réveil transcriptionnel et que les ARNnc SATIII s'y accumulent.
Le doctorant ou la doctorante se concentrera sur la caractérisation de ces protéines nouvellement identifiées afin de mieux définir leur rôle dans le maintien de l'hétérochromatine péricentrique alors même qu'elle subit un réveil transcriptionnel potentiellement délétère pour la stabilité du génome.

Ce projet s'intègre dans le projet global de l'équipe qui vise à comprendre les mécanismes associés à la chromatine, et tout particulièrement l'hétérochromatine, qui contrôlent l'intégrité du génome et l'expression des gènes chez les eucaryotes, avec un intérêt particulier pour le rôle et le mode d'action des ARN régulateurs.
Nous disposons déjà au sein de l'équipe et de l'unité de l'équipement nécessaire à la réalisation de ce projet de recherche.

Culture de cellules humaines, transfection cellules humaines, Microscopie (DNA/RNA FISH et immunofluorescence), RNA immunoprécipitation suivie de RT-qPCR/-seq , ChIP-qPCR/-seq, Cut&Run-qPCR/-seq, western blot.