Alternance - Technicien de Recherche Génomique H/F

Institut Pasteur

ALTERNANCE - Technicien de recherche génomique H/F/X

L'étudiant.e travaillera au sein de l'équipe Régulation spatiale des génomes, située à l'Institut Pasteur de Paris, dirigée par le Pr. Romain Koszul, sous la direction de Pauline Larrous, ingénieure de recherche.
Sa mission sera de produire des librairies d'une approche génomique maitrisée par le laboratoire et appelée metaHiC à partir d'échantillons provenant du microbiote intestinal d'une cohorte mère-enfant originaire de Bangui, en République Centrafricaine. Et ce, afin d'y caractériser des déséquilibres et d'en identifier les causes.

Missions
Les activités de l'étudiant.e consisteront à :
.pré-traiter les centaines d'échantillons de cette cohorte reçus et disponibles au laboratoire, à maintenir la traçabilité des traitement grâce à notre système de cahier de laboratoire électronique,
.à poursuivre l'application de la technique de metaHiC grâce à des kits.
.enfin, des librairies de séquençage haut débit type Illumina seront générées, séquencées et les données stockées sur les bases de données du laboratoire. Un travail de synthèse des résultats sera attendu de sa part afin de valider la qualité des librairies avant leur séquençage NGS.

L'étudiant.e pourra participer à l'analyse informatique des données si il/elle le souhaite, en sachant que des informaticiens travaillent dans le laboratoire. Cette participation pourra également se faire sous forme d'observation, suivant les compétences précises du candidat.e.