Chercheuse-Chercheur - Iab H/F

Inserm

Missions principales

-Réaliser des études structurales de la tête du spermatozoïde par tomographie cryo-électronique (cryo-ET).

-Déterminer la localisation des protéines, analyser l'architecture moléculaire de l'acrosome et étudier les interactions protéiques.

-Mettre en oeuvre l'intégralité du flux de travail cryo-ET : préparation des échantillons, vitrification, usinage par cryo-FIB (cryo-FIB milling), acquisition des données, traitement des images et interprétation structurale.

-Travailler en étroite collaboration avec la ligne de lumière cryo-EM de l'ESRF (CM01).

Activités principales
-Préparer des échantillons de spermatozoïdes pour la cryo-ET (vitrification, cryo-FIB milling).
-Acquérir des séries d'inclinaison (tilt series) sur microscope Titan Krios.
-Traiter les données et reconstruire les tomogrammes à l'aide de logiciels standards et de pointe.
-Interpréter l'architecture cellulaire 3D et l'intégrer à des données complémentaires.
-Concevoir les expériences, gérer les jeux de données et assurer la tenue de la documentation.
-Garantir la traçabilité des workflows et contribuer aux rapports ainsi qu'aux productions scientifiques.
Spécificité(s) et environnement du poste
-Travail en étroite collaboration avec la ligne de lumière cryo-EM de l'ESRF (CM01).
Connaissances
-Principes de la cryo-ET, instrumentation et contraintes liées à la préparation des échantillons.
-Bonne compréhension des algorithmes de traitement d'images en cryo-ET.
-Des connaissances en biologie cellulaire et en ultrastructure des cellules eucaryotes constituent un plus.
Savoir-faire
-Compétences pratiques en préparation d'échantillons cryo-EM/ET par vitrification.
-Une expérience pratique en cryo-FIB milling, préparation ciblée de lamelles et workflows corrélatifs constitue un atout (formation assurée).
-Maîtrise du fonctionnement de microscopes électroniques haut de gamme (formation assurée).
-Capacité à gérer des pipelines complexes de traitement d'images avec un contrôle strict des métadonnées.
-Aptitude à résoudre des problèmes liés à des logiciels et algorithmes complexes de cryo-ET.
Aptitudes
-Autonomie et capacité à gérer un workflow complet.
-Excellentes compétences de collaboration avec les collègues de la ligne de lumière et les partenaires externes.
-Adaptabilité dans un domaine méthodologique en évolution rapide.
Expérience(s) souhaité(s)
-Expérience démontrée en cryo-ET ou cryo-EM (niveau doctorat ou postdoctorat).
-Une expérience préalable en cryo-FIB milling est fortement souhaitée.
-Une expérience sur des cellules de mammifères ou des systèmes structuraux complexes est un avantage.