CDI de Projet Ingénieur Microbiologie Support à la Coordination de Projet H/F Ifremer

Date de clôture de réception de candidatures : 12/02/2026

Qui sommes-nous ?

L'unité Microbiologie, Aliment, Santé, Environnement (MASAE) étudie les micro-organismes d'origine anthropique ou marine présents dans le milieu littoral et dans les aliments d'origine marine.

Au sein de l'unité, le Laboratoire Santé, Environnement et Microbiologie (LSEM) développe des activités de recherche sur les micro-organismes pathogènes pour l'homme (virus et bactéries) dans le continuum terre-mer et les coquillages, pour en comprendre les mécanismes de transfert, de persistance, ou émergence au sein de l'environnement littoral. La recherche effectuée au LSEM s'appuie sur des activités de référence (le LSEM est Laboratoire National de Référence pour la microbiologie des coquillages), et de connaissance de la qualité sanitaire du littoral (le LSEM coordonne le REMI, réseau pour la surveillance microbiologique des coquillages et les études sanitaires).

Le LSEM participe à des projets de recherche européens ou nationaux tel que le projet OBEPINE+ (financement ANR-France 2030) dans lequel s'inscrit ce poste.

Dans le cadre de France 2030, sur la stratégie d'accélération Maladies infectieuses émergentes - Risque NRBC' (France 2030), le projet OBEPINE+ a pour objectif de mettre en place une plate-forme sous forme d'un réseau de partenaires capable de réagir rapidement, voire d'anticiper l'apparition d'un nouveau virus à travers l'analyse des eaux usées, dans le cadre d'une recherche collaborative.

Le projet vise à utiliser les eaux usées pour caractériser l'émergence de virus dans la population et développer des outils d'alerte, dans une approche une seule santé'.

Le projet OBEPINE+ couvre l'ensemble du territoire métropolitain et outre-mer en s'appuyant sur des sites ateliers. OBEPINE+ associe 16 partenaires institutionnels et les trois opérateurs de traitement des eaux usées. Par ailleurs le consortium s'appuie, selon les nécessités épidémiologiques, sur les Centres Nationaux de Référence (CNR) hospitaliers ou vétérinaires, Santé Publique France et les Agences Régionales de Santé ou encore le réseau de laboratoire ADILVA.

OBEPINE+ comprend deux grands axes : un axe portant sur les infrastructures et systèmes d'alerte, et le second sur le développement et optimisation de nouvelles méthodes, incluant chacun quatre work-packages (WP). Le LSEM est en charge du WP7 sur le développement de méthodes analytiques moléculaires, réunissant 14 partenaires. Par ailleurs le LSEM contribue aux WP3 (suivi de quatre sites ateliers en zone littorale), WP4 (constitution d'une aquabanque), WP6 (stratégie et méthodes d'échantillonnage) et WP9 (analyse du risque infectieux).

Sous la responsabilité de la cheffe de laboratoire et de la responsable du projet au sein de l'équipe, vous aurez pour mission de coordonner les échanges Ifremer au sein du consortium OBEPINE+.

Quelle sera votre mission ?

Votre mission principale consistera à animer et coordonner la réalisation du WP7 dont le laboratoire est responsable, en étroite collaboration avec la responsable scientifique Ifremer du projet. Vous contribuerez par ailleurs aux WP dans lesquels le laboratoire LSEM est impliqué.

Quelles seront vos activités ?

- Coordination et animation des activités du WP7 : mise en place d'un calendrier de réunions, animation de groupes de travail, rédaction des comptes rendus, rédaction de protocoles sous forme de SOP pour partage avec les partenaires,
- Suivi du projet en lien avec la coordinatrice du WP7,
- Création et animation de la page web Obepine+ sur le site LSEM/MASAE,
- Synthèse des résultats liés aux WP dans lesquels le laboratoire est impliqué, participation à l'interprétation et la valorisation,
- Participation aux réunions internes au LSEM et aux réunions du projet
- Gestion des livrables sur le site officiel Résana (site de partage de données)
- Organisation de l'échantillonnage (WP3) y compris en situation de crise épidémiologique : veiller à la qualité du prélèvement et du transport des échantillons
- Intégration des prélèvements réalisés dans l'aquabanque (WP4): traçabilité, implémentation de la base de données Labcollector avec les échantillons collectés et bancarisés dans le cadre de ce projet, mise à disposition et envoi d'échantillons aux partenaires

Comment se déroulera votre activité ?

- Temps plein
- Missions terrain ponctuelles
- CDI de projet
- Evènement qui marquera la fin du CDI de projet : réunion de clôture du WP7 qui se déroulera au plus tard le 31 décembre 2029