Post-Doctorant Biophysique Computationnelle H/F

INRIA

Post-Doctorant F/H Biophysique computationnelle

Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Thèse ou équivalent

Fonction : Post-Doctorant

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

The Inria research centre in Lyon is the 9th Inria research centre, formally created in January 2022. It brings together approximately 300people in 17 research teams and research support services.

Its staff are distributed in Villeurbanne, Lyon Gerland, and Saint-Etienne.

The Lyon centre is active in the fields of software, distributed and high-performance computing, embedded systems, quantum computing and privacy in the digital world, but also in digital health and computational biology.

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre d'un partenariat

- non pertinent,

Le poste est à pourvoir au sein de l'équipe MOSAIC de l'Inria. L'activité scientifique de l'équipe s'articule autour de la
modélisation mathématique et de la simulation numérique dans le domaine de la biologie du développement végétal.
Le poste est à pourvoir dans le cadre du projet MorphosysTens financé par le
programme Explorae de l'Inrae. L'objectif du projet est de combiner les formalismes de la
morphoélasticité avec la biologie des systèmes.

Mission confiée

Sous la supervision d' (chercheur à l'Inria), les deux principales tâches du jeune chercheur recherché
seront (i) de développer un formalisme mathématique pour adapter une approche systématique
aux équations différentielles à base de tenseurs et (ii) de réaliser des simulations numériques (FEM) pour
simuler la morphogenèse des tissus végétaux en croissance. Les développements théoriques et numériques
seront appliqués à l'étude de la morphogenèse des graines chez la plante modèle
Arabidopsis thaliana, en étroite collaboration avec les biologistes du laboratoire d'accueil.
Les simulations numériques seront réalisées à l'aide de la bibliothèque python dédiée basée sur la MEF
BVPy, développée par l'équipe d'accueil.
Pour plus de contexte et de détails :
Site web de l'équipe :et site web du laboratoire de biologie d'accueil :
Bibliothèque BVPy V1.0 : dans le Journal of Open Source Software et dépôt

Collaboration :
Le candidat retenu sera supervisé par Olivier Ali, en étroite collaboration avec les
ingénieurs de recherche de l'équipe d'accueil et en interaction avec les biologistes du laboratoire d'accueil
.

Principales activités

Dérivation théorique de motifs régulateurs à partir des principes fondamentaux de la biophysique, pertinents dans le
contexte de la morphomécanique des tissus végétaux.
Mise en oeuvre de simulations numériques basées sur la méthode des éléments finis (FEM), inspirées des résultats expérimentaux.
Interprétation des résultats de simulation à la lumière des développements théoriques susmentionnés.

Activités secondaires :
Activités d'enseignement et de formation (non obligatoires).

Compétences

Compétences techniques :

- Expertise en géométrie différentielle
- Expertise en calcul scientifique
- Connaissance du FEM Langues : anglais français (facultatif, mais peut être utile pour les interactions quotidiennes et informelles)

Autres compétences : expérience avec les outils de programmation modernes (IDE, gestion des versions...) Présidence de réunions scientifiques

Avantages

- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale

Rémunération

2788 € gross salary / month