Bioinformaticien - Bioinformaticienne H/F

Neoplants

Le bioinformaticien que nous recherchons possède une grande expertise en biologie computationnelle, en analyse de données et en outils logiciels permettant d'interpréter des données biologiques complexes. Son rôle consiste à collaborer avec des scientifiques, des ingénieurs, des techniciens et des chercheurs afin de développer des pipelines, d'analyser des ensembles de données à haut débit et de générer des connaissances qui favorisent les découvertes scientifiques et l'innovation.
En travaillant chez Neoplants, le / la bioinformaticien.ne a l'opportunité unique de participer à des recherches de pointe et à des projets ambitieux qui peuvent littéralement changer le monde, au sein d'une équipe collaborative, interdisciplinaire et très engagée.

Mission principale (liste non exhaustive) :
- Concevoir, mettre en oeuvre, optimiser et maintenir des flux de travail et des pipelines bioinformatiques pour les données à haut débit et analyser des ensembles de données à grande échelle.
- Analyser et intégrer des ensembles de données multi-omiques pour soutenir la R&D, le développement de produits et la conception expérimentale.
- Prototyper et tester rapidement des approches computationnelles pour relever de nouveaux défis scientifiques.
- Collaborer avec des équipes interfonctionnelles pour traduire les données brutes en connaissances biologiques et en outils d'aide à la décision.
- Évaluer et mettre en oeuvre les nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques.
- Documenter les flux de travail et communiquer clairement les résultats aux parties prenantes techniques et non techniques.
- Contribuer à la propriété intellectuelle, aux publications, aux présentations à mesure que l'entreprise se développe et aux demandes de subventions, le cas échéant.
- Se tenir au courant des nouveaux outils, méthodes et technologies bioinformatiques.

Expérience requise :
- Maîtrise ou doctorat en bio-informatique, biologie computationnelle, informatique, statistiques ou dans un domaine connexe (ou expérience professionnelle équivalente).
- Solides compétences en programmation dans des langages tels que Python, R ou Perl.
- Maîtrise des outils, bases de données et plateformes bioinformatiques (par exemple, NCBI, Ensembl, UCSC Genome Browser, BLAST, GATK).
- Expérience avec les données de séquençage à haut débit (par exemple, RNA-seq, WGS, WES, scRNA-seq).
- Maîtrise du machine learning, de la modélisation statistique ou de la visualisation de données est un plus.
- Solides compétences en résolution de problèmes et capacité à travailler de manière autonome et collaborative.
- Excellentes compétences en communication écrite et orale.
- Rigueur scientifique extrême et souci du détail.
- Capacité à travailler de manière autonome avec peu ou pas de supervision.
- Esprit d'équipe, bonnes compétences interpersonnelles et communicationnelles.
- Maîtrise de l'anglais (oral et écrit)

Atouts supplémentaires :
- Expérience dans les environnements de cloud computing (AWS, GCP ou Azure).
- Connaissance des systèmes de gestion des flux de travail (par exemple, Snakemake, Nextflow, CWL).
- Formation en biologie moléculaire, génétique ou recherche biomédicale.
- Connaissance du contrôle de version (Git/GitHub) et des pratiques de codage collaboratif.