CDD Technicien Supérieur en Halieutique H/F Ifremer

Date limite dépôt des candidatures : 08/10/2025

L'unité Ifremer intégrée dans l'UMR MARBEC mène des travaux de recherche sur la biodiversité marine, ses usages et sa conservation, plus particulièrement en écologie halieutique et en aquacultures durables. Dans ce cadre, l'équipe du Laboratoire Évolution et Génétique des Populations Marines (LEGPM) est spécialisée dans les approches génomiques pour décrire la diversité et l'évolution des populations / espèces / écosystèmes et développe des activités de recherche selon deux axes :(i) la compréhension et la prédiction de l'évolution darwinienne des biocénoses marines naturelles ou exploitées et des services écosystémiques associés, notamment en réponse aux différentes facettes du changement global, et (ii) l'utilisation des outils génétiques et génomiques pour l'étude de l'écologie des populations et des communautés marines. Située sur deux sites (Montpellier et Sète), l'équipe du LEGPM a accès à un laboratoire eDNA, à de nombreuses plateformes de biologie moléculaire et au serveur de calcul Ifremer DATARMOR.

Introduction du poste à pourvoir et de sa position dans l'organigramme

Sous la responsabilité hiérarchique du Responsable d'Unité (Marbec) et du Responsable de laboratoire (LEGPM), vous aurez pour mission de mettre en place, réaliser et suivre les échantillonnages de la faune ichtyologique des eaux métropolitaines françaises à bord des campagnes halieutiques de l'Ifremer. Cette mission s'inscrit dans le cadre du Projet Ciblé DIVE-SEA du PEPR (Projets et Équipements Prioritaires de Recherche) ATLASea (https://www.atlasea.fr/). L'objectif de ce programme est de séquencer les génomes de 4500 espèces marines eucaryotes de la ZEE française d'ici 2031. Le Projet Ciblé DIVE-SEA est spécifiquement chargé de l'échantillonnage de ces 4500 espèces, comprenant une part significative de poissons, dont la responsabilité de l'échantillonnage incombe à l'Ifremer.

Missions principales

Vous aurez pour mission :
- d'évaluer la faisabilité des échantillonnages selon les Procédures Opérationnelles Normalisées (PON) définies par le PEPR ATLASea et de proposer des modifications le cas échéant,
- de planifier et organiser les échantillonnages à bord des campagnes halieutiques en s'assurant du respect des PON,
- de participer à certaines campagnes pour l'échantillonnage,
- de former les équipes embarquantes à l'échantillonnage selon les PON,
- d'assurer le transfert sécurisé des échantillons vers le Museum d'Histoire Naturelle de Paris pour la mise en collection des spécimens et vers les Génoscope pour le séquençage,
- d'assurer le suivi et la traçabilité des échantillons et de leurs métadonnées.

Activités principales

- Evaluer, tester et mettre au point les échantillonnages de tissus de poisson selon les PON définies par le PEPR ATLASea ; une session de test sera mise au point en collaboration avec les équipes du Génoscope et de l'Ifremer Palavas en prenant le bar comme cas d'étude début 2024.
- Mettre au point le protocole de photographie de spécimens qui sera déployé à bord des navires avant prélèvement des tissus et achat du matériel adéquat si nécessaire
- Préparer et planifier la participation aux campagnes halieutiques pour l'échantillonnage : commande et préparation du matériel pour prélèvements de tissus et des agents chimiques de conservation (azote liquide pour congélation flash, alcool pour spécimens), préparation des engins spécifiques de collecte et du matériel de photographie des spécimens, envoi des différents matériels à bord, organisation des équipes d'échantillonnage
- Participer à certaines campagnes halieutiques pour coordonner l'équipe d'échantillonnage ATLASea
- Former les équipes embarquantes à l'échantillonnage ATLASea en cas d'absence de la campagne
- Organiser le transport des spécimens vers le Museum d'Histoire Naturelle de Paris et des échantillons de tissus vers le Génoscope par cryo-transporteur à la débarque des campagnes
- Gérer la base de données et de métadonnées des échantillons selon la trame définie par le PEPR ATLASea et assurer son interopérabilité avec les bases de données du SIH Campagnes de l'Ifremer

Champs relationnel

- En interne : toutes unités halieutiques de l'Ifremer, notamment les responsables de mission opérationnels et scientifiques des campagnes halieutiques et les équipes embarquantes
- En externe : Museum d'Histoire Naturelle de Paris, Génoscope, plus généralement partenaires du PEPR ATLASea