Contrat Post-Doctoral en Glycochimie Synthèse d'Oligosaccharides d'Intérêt Thérapeutique H/F CNRS

Détail du poste

Synthèse d'oligosaccharides d'intérêt thérapeutique

Les Escherichia coli productrices de Shiga toxine (STEC, pour Shiga toxin-producing Escherichia coli) sont responsables d'infections gastro-intestinales sévères dont la gravité des symptômes varie de diarrhées légères à une colite hémorragique, pouvant évoluer vers un syndrome hémolytique et urémique (SHU) potentiellement mortels. Le sérotype E. coli O157 :H7 est le plus fréquemment isolé dans les pays industrialisés. Une des toxines semble présenter une préférence pour l'antigène P1 (Gal1-4Gal1-4GlcNAc1-3Gal1-4Glc) et plus précisément pour le trisaccharide terminal Gal1-4Gal1-4GlcNAc. Ce motif est donc l'élément clé pour la conception de composés d'intérêt thérapeutique.
Dans ce contexte, il est important d'avoir accès à ces oligosaccharides d'intérêt et possédant une fonction réactive en position non réductrice de type allyle, 3-aminopropyle ou propargyle pour des conjugaisons ultérieures sur des surfaces avec un fluorophore ou toute autre entité. Les oligosaccharides ciblés sont donc le trisaccharide terminal Gal1-4Gal1-4GlcNAc et le pentasaccharide complet de l'antigène P1 naturel Gal1-4Gal1-4GlcNAc1-3Gal1-4Glc.
La synthèse sera effectuée par une synergie entre la (glyco)chimie organique développée à l'ICSN et la biotechnologie pour accéder à des sous-structures de ces oligosaccharides, expertise de l'entreprise Elicityl. Une stratégie de synthèse unifiée sera basée sur un accès à de grandes quantités (jusqu'à 1 kg) de N-acétyl-lactosamine et de lactose par Elicityl et qui représente les deux matières premières nécessaire à ces synthèses.

Activités
- Rechercher, concevoir et développer des techniques de synthèse chimique adaptées aux finalités d'une problématique scientifique
- Participer à l'élaboration et à la conduite de projets de recherche
- Choisir les techniques de synthèse adaptées ; mettre au point les procédures et les modes opératoires dans le cadre d'un projet de recherche
- Coordonner ou effectuer la caractérisation courante des produits préparés
- Valider les données et interpréter les résultats
- Présentation d'un rapport trimestriel écrit et oral

Compétences
- Solides connaissances et expériences en synthèse organique en milieu inerte et à basse température
- Expériences en synthèse multi-étapes
- Connaissance en spectrométrie (UV)
- Bonne maîtrise de l'anglais (à l'écrit)
- Compétentes rédactionnelles et en communication orale
- Esprit d'équipe

Contexte de travail

L'Institut de Chimie des Substances Naturelles est une Unité Propre de Recherche du CNRS dont les axes de recherche sont la chimie et la biologie. Il fait partie de l'Université Paris-Saclay qui regroupe, depuis 2015, les établissements de recherche et d'enseignement du sud parisien. L'ICSN est situé sur le campus de Gif-sur-Yvette et compte environ 124 agents dont 71 permanents répartis sur 3 bâtiments. Au sein du Département Chémobiologie, l'agent recruté intègrera l'équipe "Sondes et Modulateurs pour Cibles Biologiques" constituée d'environ 15 personnes. Il sera placé sous l'autorité hiérarchique du responsable d'équipe et le projet se déroulera sous la co-direction de Dr Sébastien Vidal et Dr Stéphanie Norsikian. Le laboratoire est équipé de tous les instruments nécessaires pour la réalisation du projet (HPLC, flash chromatographie automatique, réacteur de synthèse micro-onde, lyophilisateur, rotavap, etc.). Plusieurs plateformes analytiques sont présentes dans l'institut et mettent à disposition des instruments de pointe : RMN (300, 500 MHz), spectrométrie de masse (LCMS, HRMS) et diffraction des rayons X notamment.
Contraintes et risques

Le projet implique les contraintes d'Hygiène et Sécurité liées à la manipulation de produits chimiques. Les expériences seront réalisées dans un laboratoire équipé de hottes.