Bioinformaticien·ne Single Cell Multi-Omics - DevOps H/F Adoc Talent Management

Détail du poste

En tant que bioinformaticien·ne spécialisé·e en Single Cell Multi-Omics avec une forte sensibilité DEVOPS, vous contribuerez à façonner l'infrastructure de données au coeur de la plateforme technologique de l'entreprise. Vous serez chargé·e de concevoir, développer et maintenir des pipelines évolutifs pour le traitement de données multi-omiques à grande échelle (transcriptomique, épigénomique, protéomique, métabolomique).

Vous collaborerez étroitement avec des chercheurs en intelligence artificielle, des biologistes des systèmes et des experts en drug discovery afin de garantir la fiabilité, la reproductibilité et l'efficacité des flux de données utilisés en R&D interne et dans les collaborations externes.

Vos missions :
- Implémenter et optimiser des pipelines avec Snakemake ou Nextflow
- Maintenir des bibliothèques internes et des environnements conteneurisés (Docker, Singularity)
- Réaliser des analyses bioinformatiques primaires (QC, alignement, clustering, expression différentielle...)
- Standardiser les entrées de données pour une intégration fluide dans les modèles de deep learning
- Intégrer et évaluer les outils bioinformatiques de pointe en single-cell/multi-omics
- Créer des dashboards et accompagner l'interprétation des résultats

Ce poste offre une grande autonomie, des défis scientifiques stimulants, et des opportunités de publication et de collaboration à l'international. Il peut être ouvert à Paris, ailleurs en France ou à l'international (possibilité de télétravail).
- Doctorat ou Master en bioinformatique, avec une spécialisation en single-cell multi-omics
- Expérience confirmée en DEVOPS appliqué à la bioinformatique
- Excellente maîtrise de Python, R, Dash, Bash/Shell
- Connaissance complète du cycle de vie des données : extraction, traitement, analyse, ingénierie logicielle
- Maîtrise de Snakemake et/ou Nextflow
- Bonnes pratiques de développement : documentation, versioning, reproductibilité
- Une expérience avec les outils d'analyse QC, d'alignement et de single-cell est un plus
- Excellentes compétences en communication, esprit d'équipe et goût pour le travail multidisciplinaire en contexte startup
- Maîtrise de l'anglais (le français est un atout)

Vous êtes agile et autonome, et êtes capable de prendre en main rapidement l'exploration, l'extraction (scraping), le traitement et l'analyse secondaire de données single-cell multi-omics de natures et de sources variées (spatial transcriptomics, métabolomique, etc.).

Vous avez déjà démontré votre capacité à mobiliser des méthodes et outils à l'état de l'art, en utilisant des frameworks variés, des approches agentiques, ou encore des LLMs pour enrichir et structurer les métadonnées.

Enfin, vous faites preuve d'un véritable esprit entrepreneurial et savez livrer rapidement un POC, que vous êtes capable d'améliorer de façon itérative, avec rigueur et créativité.

Adoc Talent Management recrute un.e Responsable R&D - Plateforme de Simulation en Temps Réel pour les Réseaux Électriques pour un groupe international de premier plan spécialisé en solutions TIC et énergie. Dans le cadre de son engagement en innovation de pointe, l'entreprise crée une équipe dédiée en Europe afin de développer une plateforme de simulation en temps réel nouvelle génération pour la modélisation et l'analyse des réseaux électriques.

C'est une opportunité unique pour bâtir un projet de zéro, piloter la stratégie technique et diriger une équipe à fort impact qui façonnera l'avenir des technologies de simulation des réseaux électriques.