Ingénieur de Recherche en Biologie des Systèmes Biologie Expérimentale - Bioinformatique à Sys2diag H/F CNRS

Détail du poste

L'Ingénieur de recherche (H/F) sera en charge de développer et de mettre en oeuvre des approches informatiques et/ou statistiques pour traitement et d'analyse de données hétérogènes de la biologie à grande échelle générées par le laboratoire. Ces approches inclus l'IA sous toutes ses formes. Il/elle sera en lien avec les équipes de modélisation des systèmes complexes, de bioinformatique/Biostatistiques et de biologie du laboratoire. En particulier, il/elle développera des approches logicielles d'intégrations, d'analyses et de représentations de données liées à la biologie en temps réelle et de terrain.
Activités
- Concevoir et mettre en oeuvre des méthodes informatiques (incluant l'IA) pour analyser et interpréter les données génomiques, transcriptomiques et protéomiques, cliniques sociétales récoltées dans le cadre de projets du laboratoire.
- Mettre en place les stratégies expérimentales de production de données en lien avec les équipes de biologistes.
- Développer et maintenir des bases de données et des outils logiciels pour l'analyse de ces données
- Reporter et Collaborer avec les chercheurs de l'organisation en charge des projets,
Participer aux réunions de conceptions des expériences courantes dans les domaines de la biochimie, chimie, biologie moléculaire et l'analyse des données.
- Communiquer les résultats au chercheur référent, aux équipes et à la communauté scientifique lorsque c'est demandé à travers des publications, des présentations et des réunions scientifiques.
Compétences
Savoirs / connaissances :
Master en informatique et/ou bio-informatique et/ou biostatistiques.
Maîtrise des outils d'analyses de données biologiques,cliniques et sociétales
Bonne connaissances et forte avidité pour les approches d'IA.
Connaissances des outils de base de bioinformatique omics, de modélisation des systèmes et/ou de biologie structurale.
Pratique des statistiques de base et de la programmation dans au moins un langage de script, tel que Python ou R.
Connaissances appréciées en biologie
Savoir-faire :
Mettre en oeuvre et/ou développer de nouveaux outils d'analyse de données hétérogènes de la biologie (incluant l'IA)
Planifier rigoureusement les étapes scientifiques et rédiger, actualiser et adapter les procédures techniques.
Analyser et interpréter de façon critique les résultats expérimentaux. Utiliser des méthodes statistiques et IA pour valider les conclusions. Rassembler et mettre en forme les résultats sous forme de rapport.
Utilisation des outils de programmation en bioinformatique (Python, R, etc.) pour la modélisation des systèmes biologiques et la simulation.
Rédaction de rapports, articles scientifiques et présentations. Maîtrise des outils informatiques de bureautiques.
Bonnes capacités en communication aussi bien auprès de la communauté scientifique que pour vulgariser les résultats pour des publics non spécialisés.
Savoirs-être :
Faire preuve de rigueur et de précision dans l'organisation et la réalisation des expériences ainsi que l'analyse des données.
Collaborer efficacement au sein d'une équipe multidisciplinaire, partager les connaissances et contribuer au sein de la communauté scientifique.
Appliquer les règles de confidentialité, d'éthiques scientifiques nécessaires ainsi que les normes d'hygiène et sécurité
Travailler de manière autonome tout en respectant les objectifs du projet.

Contexte de travail

Sys2Diag est une alliance entre le CNRS, la plus grande institution gouvernementale de la recherche scientifique en France, et le groupe Français ALCEN. Sys2Diag s'est engagé à effectuer des recherches interdisciplinaires de pointe et innovantes dans le diagnostic médical et environnemental, ainsi que dans l'ingénierie d'une nouvelle génération de dispositifs de détection moléculaire de terrain. Le personnel est tenu à la confidentialité.
Disposant de ressources académiques et privées, Sys2Diag accélère le transfert des découvertes scientifiques vers des applications industrielles. Sys2diag se consacre à inventer des solutions technologiques pour le diagnostic du futur. La personne travaillera sous la responsabilité hiérarchique du responsable de Projet CNRS de SYS2DIAG et du Directeur d'Unité.
Contraintes et risques

Risques liés au travail sur poste informatique