Ingénieur·e DevOps pour le Déploiement d'Un Entrepôt de Données Génomiques - Renabi Mudis4ls - Marseille H/F CNRS

Détail du poste

En tant qu'Ingénieur·e DEVOPS spécialisé·e en données massives, vous jouerez un rôle clé dans la conception, le déploiement et l'optimisation d'un entrepôt de données génomiques de pointe. Votre expertise sera essentielle pour son intégration au sein d'une fédération européenne d'entrepôts de données, contribuant ainsi à la facilitation du partage et la réutilisation de données entre centres de recherche.

Activités
Vos responsabilités s'articuleront autour des axes suivants :
- Déploiement et Maintenance des Infrastructures Data :
- Identifier, implémenter et configurer les briques logicielles nécessaires à la construction et au maintien en conditions opérationnelles de l'entrepôt de données.
- Assurer l'intégration de ces composants dans un écosystème existant et évolutif.
- Automatisation :
- Concevoir et mettre en oeuvre des pipelines CI/CD pour automatiser les déploiements et la gestion de l'infrastructure (Infrastructure as Code).
- Automatiser les processus de gestion des données (transferts sécurisés, chiffrement, gestion des accès, etc.) pour garantir efficacité et conformité.
- Mettre en place et optimiser l'observabilité des systèmes (monitoring, alerting, traçabilité) afin d'assurer une disponibilité et des performances optimales.
- Développement et Sécurité :
- Développer des interfaces utilisateur intuitives pour la gestion et le suivi des données au sein de l'entrepôt.
- Implémenter des solutions de sécurité permettant de protéger l'intégrité et la confidentialité des données et du système.
- Documentation et Veille Technologique :
- Rédiger et maintenir une documentation technique claire et à jour.
- Assurer une veille technologique constante dans les domaines de la gestion des données, du Big Data et de la cybersécurité.
Compétences
Nous recherchons un profil justifiant d'une expérience et d'une maîtrise des technologies suivantes :
- Systèmes et Scripting :
Maîtrise des environnements Linux.
Maîtrise approfondie de Python et Bash. Des connaissances en C ou GO (Golang) seraient un plus.
- Cloud et Conteneurisation :
Bonne connaissance en virtualisation Cloud (ex : OpenStack) et en conteneurisation (ex : Docker, Kubernetes, Podman, Singularity).
- Déploiement et CI/CD :
Maîtrise d'un outil d'automatisation des déploiements (Ansible).
Maîtrise des outils de gestion de versions (Git, GitHub, GitLab) et des méthodologies Agiles.
- Bases de Données :
Bonne connaissance des systèmes de gestion de bases de données relationnelles (PostgreSQL, SQLite) et des outils de requêtage associés.
- Monitoring et Logging :
Expérience avec les outils de monitoring et de logging (ex : ELK Stack, Prometheus, Grafana).
- Architecture et Réseaux :
Compréhension des concepts d'architecture des systèmes distribués et des réseaux.
Maîtrise des procédures et des bonnes pratiques en matière de sécurité informatique.
- Chiffrement :
Connaissances des algorithmes et techniques de chiffrement de données seraient un atout

- Qualités personnelles
Capacité avérée à travailler en mode projet et à collaborer efficacement au sein d'une équipe pluridisciplinaire.
Réactivité, autonomie, initiative et rigueur.
Sens de l'organisation et capacité à gérer les priorités.
Excellent esprit d'équipe et sens de la collaboration.
Maîtrise de l'anglais technique (écrit et oral), niveau B2 minimum.

Contexte de travail




L'Institut Français de Bioinformatique (IFB) est une infrastructure nationale en biologie-santé regroupant 28 plateformes régionales de bioinformatique et une unité coordinatrice, IFB-core (UAR 3601). L'IFB a pour mission de mettre en place un service national en bioinformatique, accessible à tous les chercheurs en sciences du vivant, sous la forme d'une infrastructure environnée (stockage, calcul, environnement logiciel, bases de données, serveurs web nationaux, support aux usagers, accompagnement de projets, formations...), de répondre à l'évolution rapide des technologies et des besoins, et d'anticiper les futurs développements du domaine.

C'est dans ce contexte que ce profil s'inscrit avec l'ambition de déployer un entrepôt de données génomiques national et d'intégrer une fédération internationale d'entrepôt de données génomique existante afin de permettre aux chercheurs de pouvoir stocker, traiter et partager des données génomiques.

Ce déploiement se fera au sein d'infrastructures cloud pilotées par l'IFB, le Département des Systèmes d'Information de l'INSERM et le Centre Informatique National de l'Enseignement Supérieur (CINES) qui collaborent au projet MUDIS4LS (Mutualised Digital Spaces for FAIR Life and Health Sciences).
En nous rejoignant, vous contribuerez à la mise en place d'un projet innovant au carrefour de la génomique et des technologies de pointe. Vous aurez l'opportunité de travailler sur des défis techniques stimulants et ainsi de participer aux premières étapes de la construction d'un système facilitant la collaboration entre chercheurs au niveau national et international.

La personne recrutée travaillera au sein de l'antenne IFB-core à Marseille, sur le campus de Luminy.
Restaurant administratif sur place.
Possibilité de faire du télétravail (jusqu'à 2 jours par semaine).
Temps de travail : 38h30/semaine et 45 jours de congés annuels.
Le travail nécessitera des déplacements occasionnels en France et à l'étranger pour participer à des réunions, des formations ou des événements.