Doctorat Mise à l'Échelle Populationnelle de Jumeaux Numériques Individus- Centrés des Oiseaux Marins H/F CNRS

Détail du poste

Doctorat Mise à l'échelle populationnelle de jumeaux numériques individus- centrés des oiseaux marins H/F.
Les oiseaux marins jouent un rôle crucial dans l'équilibre des écosystèmes marins, mais sont également fortement impactés par l'érosion de la biodiversité. Avec l'accroissement des données sur les comportements des oiseaux marins et l'émergence des outils d'intelligence artificielle, des projets ont vu le jour pour développer des avatars numériques des oiseaux marins. La thèse est financée par la Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires, lauréat de l'édition 2025 du programme Transverse du CNRS.
L'objectif principal de cette thèse est de créer un cadre d'évaluation de simulateurs IA, individus centrés, basés sur des données d'observation de biologging, permettant le passage à des conclusions à l'échelle populationnelle.
Cette thèse s'appuiera sur une base de données longitudinales collectées sur une vingtaine d'années dans l'Atlantique tropical et le Pacifique, couvrant quatre sites et six espèces. Ces données seront complétées par celles provenant de bases internationales. La thèse se décomposera en quatre étapes :
1. Sélection d'une architecture de simulation individu-centrée pré-existante (S1).
2. Développement d'un modèle permettant de passer de l'échelle individuelle à populationnelle (S2/S3).
3. Construction d'un cadre d'évaluation pour les modèles populationnels (S3/S4).
4. Prédictions sur la viabilité future des colonies sous différents scenarii de changement climatique et de pressions anthropiques (S5/S6).

Contexte de travail
La personne recrutée intégrera l'UMR MARBEC. L'Unité Mixte de Recherche (UMR) MARBEC, MARine Biodiversity, Exploitation and Conservation, a été créée le 1er janvier 2015. Ses autorités de tutelle sont l'IRD, l'Ifremer, l'Université de Montpellier et le CNRS. MARBEC est l'un des plus importants laboratoires travaillant sur la biodiversité marine et ses usages en France avec environ 300 agents, dont 90 chercheurs et enseignants-chercheurs. L'unité est implantée à Sète, Montpellier et Palavas-les-flots, ainsi que dans l'océan Indien, en Asie, en Afrique et en Amérique du Sud. Elle étudie la biodiversité marine des écosystèmes lagunaires, côtiers et hauturiers, principalement méditerranéens et tropicaux. Ses recherches portent sur différents niveaux d'intégration, des aspects moléculaires, individuels, populationnels et communautaires, aux usages de cette biodiversité par l'Homme. La personne recrutée devra disposer de compétences et d'expériences fortes en écologie ET en mathématiques, machine learning, informatique. Une appétence pour le travail en équipe, en environnement international et multilingue est attendue. Des compétences de travail de terrain avec de la faune sauvage non hébergée seraient un avantage.
La personne recrutée effectuera la majorité de son travail en condition du bureau, au laboratoire Marbec de Sète, avec de séjours à prévoir dans le laboratoire de son co-directeur de thèse à Nantes. Des activités de terrain au Brésil seront possibles même si la faisabilité de la thèse n'en dépend pas directement puisque des bases de données existantes sont déjà disponibles et suffisantes. Celles-ci seront toujours réalisées en équipe, avec la directrice de thèse et /ou ses partenaires seniors Brésiliens, et qui prennent en charge toutes les procédures de sécurité et de demandes d'autorisations.
La personne recrutée disposera d'une connexion à internet, des outils institutionnels du laboratoire (accès aux revues, a des moyens de calcul) d'un bureau et du matériel nécessaire pour réaliser ses travaux.
En sus de ses deux directeurs de thèse, la personne recrutée évoluera dans une équipe de 3 autres doctorants, et bénéficiera des partenariats étroits de la directrice de thèse avec IMT Atlantique (Brest), le LIRMM (Montpellier) ainsi que l'U. Federal de Rio Grande do Sul (UFRGS, Brésil).
Contraintes et risques
Possibles missions de terrain au Brésil. Risque Mission.
Sinon travail sur poste informatique donc statique.