Doctorant Amélioration des Images Cbct pour l'Électroporation Irréversible des Tumeurs par Modélisation et Compensation des Artefacts Métalliques et de Diffraction H/F INRIA
Talence - 33 CDD- Télétravail partiel
- 36 mois
- Bac +5
- Service public des collectivités territoriales
Les missions du poste
Doctorant F/H Amélioration des images CBCT pour l'électroporation irréversible des tumeurs par modélisation et compensation des artefacts métalliques et de diffraction
Type de contrat : CDD
Niveau de diplôme exigé : Bac +5 ou équivalent
Fonction : Doctorant
Niveau d'expérience souhaité : Jeune diplômé
A propos du centre ou de la direction fonctionnelle
Le centre Inria de l'université de Bordeaux est un des neuf centres d'Inria en France et compte une vingtaine d'équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au coeur d'un riche écosystème de R&D et d'innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l'enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique...
Contexte et atouts du poste
Le projet de thèse se déroule au sein de l'équipe MONC (INRIA Bordeaux Sud-Ouest), dans un environnement scientifique pluridisciplinaire combinant mathématiques, traitement d'image, ingénierie et médecine. L'objectif est d'améliorer la qualité des images CBCT (Cone Beam Computed Tomography) utilisées pour l'électroporation irréversible des tumeurs, en modélisant et en compensant les artefacts métalliques et de diffraction.
Les atouts du poste :
- Impact direct : Participation à une innovation technologique majeure dans le traitement du cancer.
- Environnement stimulant : Collaboration avec des experts en mathématiques, médecine et ingénierie.
- Visibilité scientifique : Opportunités de publications et de communications dans des conférences de haut niveau en traitement d'image médical.
Mission confiée
Vous contribuerez à la conception, l'implémentation et l'évaluation d'algorithmes de reconstruction CBCT robustes aux artefacts métalliques et de diffraction, dans un contexte clinique contraint.
Vos missions principales incluront :
- Identification des sources d'artefacts dans les CBCT à faible nombre de projections.
- Modélisation physique et numérique des phénomènes de diffraction liés aux aiguilles d'électroporation.
- Exploitation des données dentaires fournies par Acteon pour modéliser des géométries métalliques complexes.
- Développement et optimisation d'opérateurs de suppression d'artefacts.
- Validation quantitative et qualitative des algorithmes avec les partenaires cliniques.
Principales activités
- Revue de littérature sur la reconstruction CBCT, les artefacts métalliques et les modèles physiques associés.
- Programmation d'algorithmes en Python (et C++ si besoin).
- Utilisation de bibliothèques de traitement d'image et de deep learning (PyTorch, SimpleITK, ODL, etc.).
- Validation expérimentale sur des données simulées et réelles.
- Communication scientifique via publications, présentations en conférences, etc.
Compétences
Compétences techniques :
- Indispensables : Programmation Python, traitement d'images, reconstruction tomographique, apprentissage automatique.
- Souhaitées : Connaissances en C++, physique des rayons X, modélisation des interactions matière-rayonnement, artefacts CBCT.
Qualités personnelles :
- Curiosité scientifique.
- Sens du travail en équipe.
- Autonomie et bonne organisation.
Profil académique :
- Master 2 ou équivalent en traitement du signal, mathématiques appliquées, physique médicale ou équivalent.
- Une première expérience en imagerie médicale (stage ou projet) serait un plus.
Avantages
- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés : 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale
Rémunération
Le salaire sera de 2200€ brut, puis 2300€ brut à partir de 2026
Bienvenue chez INRIA
A propos d'Inria
Inria est l'institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l'interface d'autres disciplines. L'institut fait appel à de nombreux talents dans plus d'une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d'appui à la recherche et à l'innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'eorce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.
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