Bio-Informaticienne - Bio-Informaticien H/F CHU Dijon

Le CHU de Dijon recrute une bio-Informaticienne / un bio-Informaticien à 100%. La bio-Informaticienne / le bio-Informaticien met au point des outils et solutions informatiques permettant d'organiser, de comparer, d'analyser, de diffuser des données biologiques, physiques, chimiques. Les différentes activités et périmètres du poste :
- Conseil aux décideurs concernant les choix, les projets, les activités du domaine d'activité
- Définition des prototypages et jeux d'essai
- Définition et réalisation d'interfaces homme-machine
- Développement des progiciels et programmation nécessaires à l'exploitation des données biologiques et médicales
- Analyse en génomique comparative
- Assemblage, orfing et annotation des génomes issus du séquenceur
- Analyse de séquences biologiques
- Conception d'amorces de PCR et de sondes de détection pour le développement d'outils d'investigation des maladies infectieuses épidémiques
- Caractérisation moléculaire/Génotypage des agents responsables d'épidémies entrant dans les champs d'expertise des CNR
- Biologie évolutive
- Phylodynamique des épidémies
- Modélisation en écologie spatiale et en dynamique cellulaire et système complexes :
- Identification de marqueurs génomiques de résistance aux antimicrobiens, de virulence...
- Développement des progiciels et programmation nécessaires à l'exploitation des données biologiques et médicales incluant le développement de Pipelines d'analyse bio-informatique des données issues du séquençage haut débit (NGS).
- Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application
- Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d'activité
- Publications scientifiques et médicales en interne ou externe - Participation et présentation de travaux dans des congrès scientifiques
- Recensement et analyse des besoins des utilisateurs, spécifiques à son domaine
- Traitement et analyse de l'information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique
- Veille professionnelle
- Prise en compte des enjeux de développement durable dans le cadre de l'application des missions