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CNRS recrutement

Ingénieur de Recherche en Analyse de Données Biologiques H/F CNRS

Montpellier - 34
CDD
Résumé de l'offre
  • Bac +5
  • Service public des collectivités territoriales

Les missions du poste

Contraintes et risques

Travail sur ordinateur.

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L'ingénieur ou l'ingénieure aura en charge le développement et l'enrichissement de graphes de connaissances en immunogénétique, notamment par l'extension des graphes IMGT-KG et IMGT/mAb-KG. Il ou elle assurera la modélisation ontologique, l'intégration de nouvelles entités, l'alignement sémantique et la définition de règles logiques. La personne appliquera des méthodes de machine learning et de NLP sur des données omics et des graphes sémantiques, et développera des outils d'analyse et de visualisation adaptés aux données complexes d'immunoinformatique. Elle participera à la maintenance et à l'évolution des bases de données IMGT® (TripleStore, Neo4J) et des outils web associés, tout en valorisant ses travaux par des publications scientifiques et des communications dans des conférences internationales.
Activités
Conception et enrichissement de graphes de connaissances en immunogénétique, développement d'outils d'analyse et de visualisation, application de méthodes de machine learning sur des données omics, modélisation ontologique, et valorisation scientifique via publications et conférences.
Compétences
Connaissances en immunogénétique : structures des immunoglobulines, TCR, MHC, applications thérapeutiques (anticorps monoclonaux).
Web sémantique et Graphe de connaissance : création, interrogation, enrichissement.
Connaissance de techno : SPARQL, OWL, RDF, Jena, Fuseki, Neo4J, TripleStore,
Machine Learning : modélisation prédictive, KG embeddings, LLM et BioNLP.
Programmation avancée : Python, librairie datascience et Machine Learning, Java, Sparql.

Contexte de travail

Pour une meilleure idée de notre thématique, n'hésitez pas à consulter la liste de nos publications, accessible ici : https://www.imgt.org/IMGTinformation/IMGTreferences.php?data=publications
Les conditions de travail sont décrites dans le règlement intérieur de l'IGH.
Le site de l'IGH est disponible ici : https://www.igh.cnrs.fr/en
Le site de l'IMGT est accessible ici : https://www.imgt.org/
Pour une meilleure idée de notre thématique, n'hésitez pas à consulter la liste de nos publications, accessible ici : https://www.imgt.org/IMGTinformation/IMGTreferences.php?data=publications

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Estimation basée sur les données INSEE et les offres d’emploi similaires.

Estimation basse

36 060 € / an 3 005 € / mois 19,81 € / heure

Salaire brut estimé

40 500 € / an 3 375 € / mois 22,25 € / heure

Estimation haute

45 000 € / an 3 750 € / mois 24,72 € / heure

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Ingénieur de Recherche en Analyse de Données Biologiques H/F
  • Montpellier - 34
  • CDD
Publiée le 12/05/2025 - Réf : UMR9002-SOFKOS-054 Nombre de Postes

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