
Ingénieur de Recherche en Analyse de Données Biologiques H/F CNRS
Montpellier - 34 CDD- Bac +5
- Service public des collectivités territoriales
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Travail sur ordinateur.
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L'ingénieur ou l'ingénieure aura en charge le développement et l'enrichissement de graphes de connaissances en immunogénétique, notamment par l'extension des graphes IMGT-KG et IMGT/mAb-KG. Il ou elle assurera la modélisation ontologique, l'intégration de nouvelles entités, l'alignement sémantique et la définition de règles logiques. La personne appliquera des méthodes de machine learning et de NLP sur des données omics et des graphes sémantiques, et développera des outils d'analyse et de visualisation adaptés aux données complexes d'immunoinformatique. Elle participera à la maintenance et à l'évolution des bases de données IMGT® (TripleStore, Neo4J) et des outils web associés, tout en valorisant ses travaux par des publications scientifiques et des communications dans des conférences internationales.
Activités
Conception et enrichissement de graphes de connaissances en immunogénétique, développement d'outils d'analyse et de visualisation, application de méthodes de machine learning sur des données omics, modélisation ontologique, et valorisation scientifique via publications et conférences.
Compétences
Connaissances en immunogénétique : structures des immunoglobulines, TCR, MHC, applications thérapeutiques (anticorps monoclonaux).
Web sémantique et Graphe de connaissance : création, interrogation, enrichissement.
Connaissance de techno : SPARQL, OWL, RDF, Jena, Fuseki, Neo4J, TripleStore,
Machine Learning : modélisation prédictive, KG embeddings, LLM et BioNLP.
Programmation avancée : Python, librairie datascience et Machine Learning, Java, Sparql.
Contexte de travail
Pour une meilleure idée de notre thématique, n'hésitez pas à consulter la liste de nos publications, accessible ici : https://www.imgt.org/IMGTinformation/IMGTreferences.php?data=publications
Les conditions de travail sont décrites dans le règlement intérieur de l'IGH.
Le site de l'IGH est disponible ici : https://www.igh.cnrs.fr/en
Le site de l'IMGT est accessible ici : https://www.imgt.org/
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Estimation basse
36 060 € / an 3 005 € / mois 19,81 € / heureSalaire brut estimé
40 500 € / an 3 375 € / mois 22,25 € / heureEstimation haute
45 000 € / an 3 750 € / mois 24,72 € / heureCette information vous semble-t-elle utile ?
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