Stage Master 2 Analyse Écologique et Spatiale des Nurseries de Poissons Côtiers dans l'AMP de la Côte Agathoise H/F Ifremer

Date limite de réception des CV et lettres de motivation : le 04/12/2026

Présentation de la structure d'accueil

Le Laboratoire Environnement Ressources Provence Azur Corse (LER/PAC) est un laboratoire bi-localisé entre les sites de la Seyne sur Mer (PACA) et de Bastia (Corse). Il appartient à l'Unité Observation et écologie de la restauration des écosystèmes littoraux (COAST) du Département Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes (ODE) de l'Ifremer et rattaché au Centre Ifremer de Méditerranée. Son activité se décline suivant trois axes :

1. la surveillance et l'observation de la qualité des eaux marines et des écosystèmes littoraux ;

(ii) l'expertise sur son domaine de compétence auprès des collectivités territoriales, des organismes publics et des structures professionnelles et l'émission d'avis auprès des ministères et services déconcentrés ;

(iii) la recherche en réponse directe à des enjeux sociaux et économiques marins, à une échelle régionale, nationale et internationale.

• Introduction du poste à pourvoir et de sa position dans l'organigramme

Au sein du Département ODE et de l'Unité COAST, le stage localisé à La Seyne sur Mer, vous serez placé(e) sous la responsabilité hiérarchique du Responsable du LER/PAC et serez encadré(e) par Marc Bouchoucha.

Les zones de nurserie sont des habitats critiques pour le renouvellement des populations de poissons côtiers : les juvéniles y trouvent refuge, nourriture et conditions de croissance favorables durant les stades de vie les plus vulnérables. Malgré leur importance, les facteurs qui déterminent la fonctionnalité de ces habitats restent mal compris. Ils résultent de l'interaction de paramètres environnementaux (exposition à la houle, bathymétrie, complexité du substrat, présence d'abris, proximité de zones sableuses) et de pressions anthropiques (fréquentation nautique, pêche de loisir, turbidité, aménagements littoraux).

L'Aire Marine Protégée (AMP) de la côte agathoise (site Natura 2000 « Posidonies du Cap d'Agde », 6 152 ha) a engagé depuis 2025 un suivi des juvéniles de poissons sur substrats durs, dans un contexte de forte fréquentation littorale. Des analyses préliminaires font apparaître deux ensembles distincts : les milieux naturels abritent des assemblages plus diversifiés, tandis que les milieux artificiels sont dominés par un petit nombre d'espèces. Elles montrent aussi des concentrations de juvéniles plus élevées dans certaines zones. En revanche, les mécanismes qui expliquent ces patrons, et pourquoi des secteurs d'apparence similaire présentent des densités très différentes, n'ont pas encore été analysés.

Le stage a pour objet l'analyse et l'interprétation de ces données dans le but de :

• Comprendre les mécanismes écologiques qui structurent les nurseries (naturelles et artificielles) de poissons
• Distinguer les facteurs naturels des pressions anthropiques qui influencent le fonctionnement de ces nurseries
• Identifier les habitats juveniles de l'AMP prioritaires pour la protection et la restauration
• Préparer les futures phases d'investigation (ADNe, marquage acoustique, suivi comportemental)

Il s'agit d'exploiter de manière approfondie les jeux de données déjà acquis (campagnes 2025-2026), sans nouvelles observations en mer. La structure des peuplements de juvéniles sera caractérisée (abondances normalisées, densités, diversité, taux d'occupation) puis analysée par des approches multivariées (NMDS sur distance de Bray-Curtis, PERMANOVA, analyses de dispersion). Ces patrons biologiques seront ensuite reliés aux variables environnementales et anthropiques afin de hiérarchiser leurs effets et de produire, sous SIG, des cartes de hotspots de recrutement. Les résultats serviront de référence aux gestionnaires de l'AMP.

Quelles seront vos activités ?

• Consolider et structurer la base de données des suivis de juvéniles (données biologiques, DGPS, descripteurs environnementaux)
• Analyser la structure des peuplements de juvéniles et ses variations spatio-temporelles, et tester les facteurs environnementaux et anthropiques qui les expliquent
• Cartographier les nurseries les plus fonctionnelles et identifier les habitats prioritaires pour la protection et la restauration
• Formuler des recommandations de gestion pour l'AMP et définir les protocoles des phases suivantes (ADNe, marquage acoustique, suivi comportemental)

Avec qui allez-vous travailler ?

• En interne : les chercheurs et techniciens d'Ifremer [COAST/LER-PAC]
• En externe : la direction du milieu marin de la ville d'Agde (AMP de la côte agathoise), partenaire gestionnaire du projet et responsable des campagnes de terrain

Quelles sont les expertises que vous allez développer pendant ce stage ?

• Gestion, mise en forme et valorisation de données écologiques géoréférencées
• Analyses statistiques de données de communautés (statistiques multivariées, modèles reliant biologie et environnement) sous R
• Analyse spatiale et cartographie sous SIG (QGIS)
• Traduction de résultats scientifiques en recommandations pour la gestion d'une AMP
• Conception de stratégies d'étude complémentaires de suivi des peuplements de poissons côtiers (ADN environnemental, télémétrie acoustique)