Thèse Modélisation des Machines Moleculaires de Myxococcus Xanthus H/F Doctorat.Gouv.Fr
- Lyon - 69
- CDD
- Service public d'état
Détail du poste
Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1
École doctorale : EDISS - Interdisciplinaire Sciences-Santé
Laboratoire de recherche : LBMC: Laboratoire de biologie et de modélisation de la cellule
Direction de la thèse : Riccardo PELLARIN ORCID 0000000210547400
Début de la thèse : 2027-01-01
Date limite de candidature : 2027-01-31T23:59:59
Le/la doctorant(e) recruté(e) contribuera au projet PREBACTOR (ANR 2026), qui vise à élucider les mécanismes moléculaires de la prédation bactérienne chez Myxococcus xanthus, une bactérie prédateur clé des écosystèmes telluriques. Plus précisément, il/elle se concentrera sur la génération d'un réseau d'interactions protéine-protéine (PPI) entre les appareils Kil et T3SS* à l'aide de modèles de prédiction structurale basés sur des réseaux de neurones profonds (AlphaFold2/3, Boltz-2, RosettaFold3, etc.). L'objectif est de cartographier les interactions intra- et inter-complexes entre les protéines de ces deux systèmes, essentiels pour la prédation par contact.
Microorganisms constantly compete for survival under challenging conditions. They have evolved diverse strategies to persist and thrive, particularly in nutrient-poor environments such as soil. Myxobacteria are considered keystone species in soil ecosystems. Recent studies have shown that Myxococcus kills a broad range of prey through direct cell-to-cell contact and initiate prey lysis within 2-4 minutes. These observations suggest that prey contact triggers a signalling cascade that coordinates motility and activates a contact-dependent lytic mechanism. However, the molecular basis of this killing mechanism has remained largely unknown. In this PhD thesis, we aim to investigate the structural and functional interactions between mebrane macromolecular complexes of Myxococcus during predation using computational tools and in collaboration with experimentalists.
Le profil recherché
Publiée le 27/10/2026 - Réf : c7ff88a6b2c054b474b5f9f83b18974d
