Ingénieur en Analyse de Données Transcriptomiques H/F CNRS

Description du Poste Les Missions La personne recrutée rejoindra une équipe de recherches en Neurosciences travaillant sur les circuits nerveux des mouvements chez la souris. Il.elle devra réaliser des analyses transcriptomiques sur noyaux isolés (snRNA-seq) L'Activité La personne recrutée pourra participer, si il.elle le souhaite, aux étapes expérimentales (tri, isoation et séquençage des noyaux). Néanmoins, le poste est ciblé sur l'analyse des données, en aval des expérimentations. ACTIVITES A MENER EN AUTONOMIE:- Préparation des librairies - Contrôle qualité (doublets, contamination, intégrité des ARNs,...).- Analyse et statistiques avec Seurat: normalisation et réduction de dimension, clustering et annotation, détection des gènes différentiellement exprimés entre conditions, intégration de jeux de données multiples.- illustration des résulats: graphiques, barplots, dotplots, heatmaps, UMAPs... ACTIVITES EN COLLABORATION AVEC L'EQUIPE:- Interprétations biologiques: Comparaison de compositions cellulaires entre échantillons, hétérogénéité transcriptionnelle au sein d'une population neuronale- Validation des résultats : croisement des marqueurs identifiés avec des bases de données anatomiques, ou des expériences d'immunomarquages ou in situ.- Documentation et reproductibilité : rédaction de protocoles standardisés, archivage des scripts/données brutes/résultats (ex: GitHub).- Présentation des résultats aux réunions d'équipe- Participation à la rédaction d'articles scientifiques (ex: figures, tableaux, méthodes). Votre Profil Compétences Générales :- Formation initiale en Master 2 Bio-informatique, Biologie des Systèmes, Génomique, ou Neurosciences avec une forte composante en analyse de données.Spécifiques :- Connaître le principe du séquençage d'ANRm en noyaux ou cellules isolé.es.- Bioinformatique et biostatistiques: analyse de données single-cell/single-nucleus RNA-seq, tests statistiques, visualisation des données.- Programmation : Maîtrise de R et idéalement Seurat et Python.- Plateformes de disséminiation des codes informatiques (ex Github).Transversales :- Excellente autonomie en analyse et programmation : évolution dans une équipe de neurobiologiques sans forte expertise en programmation. - Excellente communication, capacités didactiques et de synthèse, esprit d'équipe- Anglais professionnel (présentations d'équipes et écriture en anglais impérativement). Votre Environnement de Travail Le.la candidat.e rejoindra l'équipe dirigée par Julien Bouvier, circuits neuronaux et contrôle moteur, (https://neuropsi.cnrs.fr/departements/icn/equipe-julien-bouvier/), composée d'un directeur de recherche, d'un maître de conférences, d'une ingénieure d'études, d'une assistante ingénieure, de 2 postdoctorants, de deux étudiants en thèse et de plusieurs étudiants en licence et master. Contraintes et risques Travail à l'ordinateur. Rémunération et avantages Rémunération Entre 2 466,98 € et 3 786,43 € bruts mensuels, selon expérience professionnelle et grille des salaires du CNRS. Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR9197-JULBOU-033 Secteur d'activité Informatique, Statistiques et Calcul scientifique Emploi type Ingenieur statisticien (H/F) À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche