Stage Mémoire de Fin d'Études d'Ingénieur Master 2 91 H/F Arvalis

Améliorer la pertinence du modèle Mileos® par la caractérisation de la sporée aérienne du mildiou et de l'alternariose de la pomme de terre

Sujet / contexte

Mots clés : mildiou de la pomme de terre, alternariose, modélisation, outil d'aide à la décision, sporée aérienne.

Le mildiou et l'alternariose sont les deux principales maladies foliaires de la pomme de terre. Le contrôle de ces deux maladies nécessite l'utilisation répétée de fongicides, représentant en moyenne 75% des traitements réalisés sur la culture soit environ 12 IFT fongicides/an. Les épidémies de ces deux maladies montrent une grande variabilité annuelle et spatiale, et l'outil d'aide à la décision Mileos® se révèle parfois trop prudent en début d'épidémie. La bibliographie mentionne que le piégeage des spores de maladies dans l'air pourrait apporter une amélioration significative dans ces situations en fournissant une appréciation plus juste de la quantité d'inoculum initial, difficile à modéliser.

Objectif du travail

L'objectif de ce projet est donc de répondre à deux questions méthodologiques pour améliorer la performance de l'outil : comment piéger pour obtenir des données fiables et valorisables (type et positionnement des pièges, typage des souches...) ? Comment intégrer et coupler ces données de piégeage à Mileos® (date de démarrage en fonction des piégeages, blocage de la réserve de spores du modèle en fonction des piégeages...) pour obtenir une pertinence améliorée des conseils de protection des cultures et renforcer sa notoriété et son utilisation ?

Méthodes envisagées

Le projet VOLDESPORES a débuté en 2025 par 2 années d'acquisition de données sur 2 réseaux de piégeage de spores dans l'air en Beauce et en Picardie. Outre une bibliographie complète sur le sujet des pièges à spores et de la valorisation des mesures de sporée aérienne en général, le travail à réaliser pendant ce stage sera de :

• Participer à la collecte des données par installation et relève régulière des pièges à spores en place à Boigneville et dans la région,
• Mettre en forme la base de données à partir de l'ensemble des données disponibles,
• Vérifier la pertinence du piège à spores connectés par rapport aux données relevées avec les pièges à spores classiques,
• Exploiter la base de données en vue de comparer les performances relatives des différents types de pièges, la synchronicité des captures de spores avec les conditions climatiques et les risques du modèle Mileos® ainsi que le développement épidémique sur le terrain,
• Vérifier la cohérence des identifications génétiques issues de prélèvements sur cartes FTA avec les analyses sur la sporée aérienne,
• Définir un seuil de concentration de spores dans l'air pour démarrer (ou redémarrer s'il s'agit d'une vague suivant la première) le suivi dans le modèle Mileos® et ainsi éviter de tenir compte dans les simulations d'évènements climatiques favorables précédant ce seuil,
• Définir une méthode de prise en compte des vols de spores dans l'air pour le démarrage du modèle Mileos®. Comme cela est précisé auparavant, 2 hypothèses de travail seront comparées : i) retarder le démarrage du 1er mars comme c'est le cas aujourd'hui à la date de vols de spores au-dessus du seuil défini, ii) bloquer la multiplication de l'inoculum dans le modèle tant que ce seuil n'est pas atteint par exemple en le laissant par défaut à sa valeur forfaitaire minimum de 10. Si pertinent, proposer une première version du cahier des charges d'intégration des modifications du modèle.

Profil requis

Stage de Master II avec mémoire de fin d'études. Goût pour la santé des plantes, compétence pour l'analyse statistiques des données, la modélisation : bonne maitrise d'Excel, la connaissance du logiciel statistique R est nécessaire. Permis B indispensable, véhicule personnel apprécié.