Thèse Caractérisation Structurale et Fonctionnelle du Système de Localisation des Lipoprotéines chez les Bactéries à Gram-Négatif et Implications dans l'Antibiorésistance H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : EDISS - Interdisciplinaire Sciences-Santé Laboratoire de recherche : MMSB - MICROBIOLOGIE MOLECULAIRE ET BIOCHIMIE STRUCTURALE Direction de la thèse : Elise KAPLAN ORCID 0000000349851482 Début de la thèse : 2026-09-14 Date limite de candidature : 2026-08-30T23:59:59 La résistance aux antibiotiques représente une réelle menace pour la santé humaine. La paroi cellulaire constitue la première ligne de défense des bactéries contre les antibiotiques notamment. Ancrées à la membrane, les lipoprotéines maintiennent l'intégrité de cette paroi et sont impliquées dans des fonctions vitales comme l'acquisition de nutriments et la virulence. Chez les bactéries didermes, leur transport vers la membrane externe est un processus vital assuré par le système de localisation des lipoprotéines (Lol), une cible antibactérienne reconnue pour le développement de nouveaux antibiotiques. Chez E. coli, ce système se compose d'un transporteur transmembranaire LolCDE, d'une protéine périplasmique LolA et de LolB, un récepteur lié à la membrane externe.
Le projet proposé vise à caractériser d'un point de vue fonctionnel et structural les protéines et complexes protéiques constituant ce système, conservé chez les bactéries à Gram-négatif.
Il fera appel à des techniques de biologie moléculaire (clonage), de biochimie des protéines (expression et purification, tests fonctionnels), de bio-informatique et de biologie structurale par cryo-EM et cristallographie aux rayons-X.
Les résultats obtenus permettront de mieux appréhender le fonctionnement de ce processus fondamental chez les bactéries didermes et d'assister le développement de nouveaux antimicrobiens. Chez les bactéries à Gram négatif, les lipoprotéines jouent un rôle clé dans l'adhésion, la virulence et l'absorption des nutriments. Elles contribuent également à la stabilité de l'enveloppe cellulaire, essentielle pour protéger les bactéries contre les composés externes, comme les antibiotiques. Les précurseurs de lipoprotéines sont synthétisés dans le cytoplasme, puis transportés à travers la membrane interne où ils subissent plusieurs étapes de maturation. La majorité des lipoprotéines maturées est alors acheminée vers la membrane externe par un système dédié, le système Lol (Localization of Lipoproteins), composé de cinq protéines chez E. coli. Ce processus implique l'extraction des lipoprotéines de la membrane interne par le transporteur LolCDE (un transporteur ABC), leur transfert à travers le périplasme par LolA, puis leur insertion dans la membrane externe par LolB. Le projet vise à approfondir la compréhension du fonctionnement de ce système et à développer de nouvelles molécules médicaments capables de l'inhiber. Le ou la doctorant(e) utilisera des méthodes biologie moléculaire, biochimie des protéines, microbiologie et de biologie structurale (cristallographie aux rayons-X et cryo-EM) pour mener à bien les missions du projet.