Responsable du Pôle Analyse des Données et Reséquençage H/F
Université Paris Cité
- Paris 15e - 75
- Fonctionnaire
- Bac +3, Bac +4
- Enseignement • Formation
Les compétences pour ce job
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Les missions du poste
RÉSUMÉ DU POSTE
Assurer la responsabilité scientifique, technique et organisationnelle du pôle Analyse des données
et reséquençage.
Coordonner et superviser les activités d'analyse bioinformatique des données de séquençage à
haut débit.
Encadrer et animer une équipe d'ingénieurs bioinformaticiens.
Garantir la qualité, la reproductibilité et la traçabilité des analyses réalisées sur la plateforme.
Assurer le pilotage opérationnel des projets de séquençage en interaction avec les équipes de
Recherche et les plateformes technologiques.
Participer à l'évolution des méthodes, outils et infrastructures dédiés à l'analyse des données
génomiques.
DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS
Organiser et coordonner les activités d'analyse des données de séquençage de la plateforme.
Superviser la production bioinformatique et garantir la qualité des résultats délivrés aux équipes
de recherche et aux projets translationnels.
Développer et faire évoluer les pipelines et outils d'analyse de données génomiques.
Assurer la gestion des données et le suivi des projets de séquençage.
Apporter une expertise méthodologique aux chercheurs pour l'analyse et l'interprétation des
données.
Encadrer hiérarchiquement et fonctionnellement une équipe de 5 ingénieurs bioinformaticiens :
organisation des activités, définition des priorités, suivi des projets et accompagnement des
personnels.
à la formation des utilisateurs et à la diffusion des bonnes pratiques.
Contribuer aux projets scientifiques collaboratifs et à l'évolution technologique de la plateforme.
Participation à des réunions, formations, congrès et groupes de travail.
Veille scientifique et technologique.
Le profil recherché
PROFIL RECHERCHÉ
Connaissances
G énomique, génétique humaine et biologie moléculaire.
Technologies de séquençage à haut débit (Illumina, PacBio, Oxford Nanopore).
Analyse de données NGS : panels, exomes, génomes, transcriptomique, single-cell.
Gestion et structuration des données biologiques à grande échelle.
Environnements de calcul haute performance (HPC).
B onnes pratiques de développement logiciel et de reproductibilité des analyses.
Connaissance informatique : langage de script Bash, base de données relationnelle
Bioinformatique, outils classiques d'analyse NGS...
Anglais scientifique et technique...
Savoir-faire - Compétences opérationnelles
Bioinformatique et génomique
Connaissance approfondie des technologies de séquençage à haut débit (NGS) et de leurs
applications.
Maîtrise des méthodes d'analyse de données de panels, exomes, génomes, transcriptomique (RNAseq),
single-cell et long-read.
Connaissance des principaux outils et logiciels d'analyse génomique et transcriptomique.
Bonne compréhension de la génétique humaine, de la génomique et de la biologie moléculaire.
Connaissance des formats de données biologiques (FASTQ, BAM/ CRAM, VCF, GTF, etc.) et des
standards de qualité associés.
Informatique et gestion des données
Maîtrise des environnements Linux/Unix.
Connaissance des langages de scripting (Bash, Python, Perl ou équivalent).
Connaissance des systèmes de gestion de bases de données relationnelles (MySQL, PostgreSQL ou
équivalent).
Connaissance des outils de gestion de versions (Git) et des bonnes pratiques de développement
logiciel.
Connaissance des infrastructures de calcul haute performance (HPC) et des ordonnanceurs de
tâches.
Connaissance des principes de gestion, de sécurisation et de traçabilité des données scientifiques.
Niveau II - Bac +3 Licence, Licence professionnelle
Bienvenue chez Université Paris Cité
PRÉSENTATION DE LA DIRECTION/STRUCTURE D'ACCUEIL DU POSTE
La Structure Fédérative de Recherche (SFR) Necker est une unité mixte de services, reconnue par trois
tutelles, l'Université Paris Cité, l'Inserm, et le CNRS. La SFR Necker a pour mission de développer et
d'optimiser les plateformes technologiques et de contribuer à l'animation scientifique du site Necker.
Elle est au service des équipes de recherche du site Necker mais est également ouverte aux équipes
externes.
Publiée le 21/08/2026 - Réf : 2026-2388731
