Détail du poste
Pour ce contrat de travail d'une durée de 2 mois renouvelable, la personne recrutée rejoindra l'équipe « Oncogénèse des sarcomes » dirigée par Frédéric CHIBON.
L'équipe cherche à comprendre les mécanismes chromosomiques de l'oncogenèse des sarcomes pléomorphes, caractérisés par une très grande instabilité chromosomique.
Mission principale
La personne recrutée aura pour missions :
· D'analyser les données de variants structuraux identifiés par RNAseq sur les données du TCGA
· D'Evaluer la pertinence du marqueur biologique iTRAC pour l'analyse pronostique et prédictive de la réponse au traitement systémique dans les différents types de cancers analysés par le TCGA
Activités
principales
· Développer et appliquer des scripts R
· Développer et appaliquer des pipeline d'analyse sur le cluster decalcul du Genotoul
· Mettre à jour le GitHub de l'équipe.
Spécificité(s) et environnement du poste
· Travail sur écran
Le profil recherché
Connaissances
· Connaitre la biologie des sarcomes
· Connaitre les mécanismes chromosomiques de l'oncogenèse.
· Maitriser les statistiques adaptées à ce type d'analyse
· Maitriser le langage R
· Maitriser le calcule parallélisé sur cluster
Savoir-faire
· Mener de A à Z un projet d'analyse bioinfomatique
· Produire des figures de synthèse adaptées aux messages identifiés.
· Ecrire les articles scientifiques présentant les résultats obtenus.
Aptitudes
· Rigueur scientifique
· Esprit critique
· Esprit d'initiative
Expérience(s) souhaitée(s)
· Une expérience en ananlyse bioinformatique de données génomiques tumorales sera appréciée
Niveau de diplôme et formatio...
La carte
20 Place Jean Diebold
31300 Toulouse
Publiée le 06/05/2026 - Réf : 2026-2273501
