Thèse Comment la Cohésine Etablit les Boucles d'Adn H/F

Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Toulouse École doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies Laboratoire de recherche : MCD - Molecular, Cellular and Developmental Biology Unit Direction de la thèse : Frederic BECKOUET ORCID 0000000290091852 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-21T23:59:59 La cohésine est un complexe protéique essentiel de la famille des SMC, maintenance structurelle des chromosomes, impliqué dans l'organisation tridimensionnelle du génome via la formation de boucles d'ADN, structures clés de la régulation de l'expression génique. Des altérations de ce complexe sont associées à des cancers et à des cohésinopathies, suggérant que des défauts d'architecture du génome contribuent aux dérégulations transcriptionnelles. Cependant, les mécanismes moléculaires qui gouvernent la formation, l'expansion et le maintien de ces boucles restent mal compris.
Ce projet vise à élucider les mécanismes par lesquels la cohésine structure l'ADN sous forme de boucles à travers trois axes complémentaires. Le premier axe testera l'hypothèse selon laquelle l'expansion des boucles dépend de l'activité ATPasique des sous-unités Smc, en combinant mutagenèse ciblée, approches biochimiques et analyses génomiques. Le second axe évaluera le rôle des interfaces structurales de la cohésine, en particulier Smc1-Smc3 et Smc3-Scc1, dans l'établissement des boucles, grâce à des systèmes de verrouillage contrôlé du complexe. Le troisième axe examinera le rôle du compartiment kleisine dans le maintien des boucles, en testant un mécanisme de stabilisation topologique de l'ADN à l'intérieur de ce compartiment.
Ces approches combinent génétique, biochimie et génomique à haut débit (Hi-C, ChIP-seq) dans la levure, un modèle de référence concernant l'étude des complexes SMC et l'organisation du génome, permettant d'identifier des mécanismes conservés. Ce projet apportera une compréhension intégrée des fonctions de la cohésine dans l'organisation 3D du génome et fournira des bases mécanistiques pour expliquer les dérégulations observées dans les pathologies associées, ouvrant ainsi des perspectives en biologie fondamentale. Comprendre comment le génome est organisé en 3D Comprendre comment la cohésive établit les boucles d'ADN Hi-C. Chip-seq. Biochimie. Génétique.