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Thèse Blocage de l'Invasion Tumorale dans le Gliome Infiltrant du Tronc Cérébral à l'Aide d'IA Générative et de la Technologie « Digital Cell Twin » H/F

Doctorat.Gouv.Fr

  • Bordeaux - 33
  • CDD
  • Bac +5
  • Service public d'état
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Les missions du poste

Objectifs et méthodologie
Notre projet de collaboration vise tout d'abord à effectuer une analyse approfondie du paysage moléculaire des lignées cellulaires de DIPG ayant des capacités invasives variables afin de créer le « jumeau numérique des cellules de DIPG invasives » et d'identifier des nouvelles cibles thérapeutiques prometteuses parmi les gènes pro-invasifs et leurs inhibiteurs spécifiques. La capacité pro-invasive du ou des gènes d'intérêt sélectionnés sera ensuite confirmée en laboratoire sur des cellules de lignée de DIPG en utilisant une combinaison d'approches in vitro et in vivo, des inhibiteurs pharmacologiques et des approches génétiques de perte et gain de fonction.

Résultats attendus
A travers ce projet interdisciplinaire original, qui combine la bioinformatique, l'IA et la biologie du cancer, nous espérons développer des composés anticancéreux ciblant la nature hautement invasive des cellules de DIPG, capables de traverser la barrière hémato-encéphalique et de stopper la progression de la tumeur. En conclusion, notre projet devrait déboucher à des avancées majeures dans le traitement de cette maladie pédiatrique incurable et potentiellement d'autres types de gliomes diffus.
See abstract See abstract Several in vitro and in vivo models of DIPG will be used. These include eleven DIPG cell lines, the chick embryo, an orthotopic model of DIPG in juvenile mice, various molecular approaches (CRISPR/cas9, siRNA, lentiviral transduction, omics, ...), bioinformatics, cell-based assays and the Incucyte S3 live cell imaging system.

Le profil recherché

Les pré-requis pour le candidat ou la candidate sont un bon niveau général en biologie cellulaire, cancérologie et en anglais, ainsi qu'une solide motivation. Des connaissances supplémentaires en expérimentation animale, approches omiques et/ou en bioinformatique seront particulièrement appréciées.

Bienvenue chez Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé Laboratoire de recherche : BoRdeaux Institute of onCology Direction de la thèse : Christophe GROSSET ORCID 0000000204796291 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59 Contexte scientifique
Le gliome infiltrant du tronc cérébral (ou DIPG en anglais) est l'une des formes les plus mortelles de tumeurs cérébrales pédiatriques. Les propriétés invasives et migratoires des cellules du DIPG ont un rôle clé dans l'agressivité de la tumeur et la mortalité des patients qui en résulte. Mieux connaître les mécanismes moléculaires qui gouvernent la capacité migratoire et invasive des cellules de DIPG permettrait de développer de nouvelles thérapies visant à bloquer ces processus. L'équipe MIRCADE s'est associée à DeepLife, une société de biotechnologie qui accélère la découverte de médicaments en utilisant la bioinformatique et l'intelligence artificielle (IA) générative. L'entreprise s'appuie sur l'analyse avancée des données multi-omiques, l'apprentissage automatique et la biologie des systèmes pour créer le « jumeau numérique des cellules » (ou « digital cell twin ») et sélectionner des médicaments candidats capables de franchir la barrière hémato-encéphalique.

Publiée le 03/04/2026 - Réf : 8dee81859eb947efe63ecf1c30df9a3c

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