Ingénieur d'Étude en Bioinformatique H/F

Université Côte d'Azur

Missions

- Analyse bioinformatique de données transcriptomique (bulk, long-reads, single-cell RNAseq et spatiale) dans le cadre de projets provenant des équipes CNRS pour l'axe consacré à l'exploitation des données complexes et au développement de l'intelligence artificielle appliquée à la santé respiratoire de l'IHU RespirERA.

- Mise en oeuvre et amélioration de pipelines d'analyse déjà existants dans l'équipe. Si nécessaire, développement de nouveaux pipelines.

- Veille technologique afin d'évaluer de nouveaux pipelines.

- Exploration et exploitation des données dans le but d'écrire des articles scientifiques.

Activités:

- Choisir et adapter les pipelines d'analyse transcriptomiques sur cellule unique et en « bulk RNAseq » ainsi qu'en transcriptomique spatiale aux questions biologiques posées par l'équipe de recherche.

- Analyser les résultats provenant des chercheurs de l'équipe et les replacer dans le contexte des résultats obtenus par d'autres équipes.

- Gérer les projets conjointement avec les chercheurs et doctorants de l'équipe.

- Rédiger des rapports d'expérience.

- Participer à la veille scientifique et technologique sur les analyses de données transcriptomique.