Thèse Identification et Quantification de Biomarqueurs de l'Arthrose dans les Fluides Biologiques par Spectrométrie de Masse H/F

Université Paris-Saclay GS Chimie

Établissement : Université Paris-Saclay GS Chimie
École doctorale : Sciences Chimiques : Molécules, Matériaux, Instrumentation et Biosystèmes
Laboratoire de recherche : Institut de Chimie Physique
Direction de la thèse : Marie-Claude MENET ORCID 0000000231809588
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-03-31T23:59:59

L'arthrose est une maladie dégénérative très répandue, touchant 10 % des personnes de tout âge dans le monde et 80 % des personnes de plus de 75 ans. Elle se caractérise par une altération de toute la structure de l'articulation, incluant entre autres une dégradation progressive du cartilage. À ce jour, il n'existe aucun traitement contre l'arthrose autre que l'utilisation d'analgésiques. Il est donc essentiel de rechercher des biomarqueurs adéquats permettant l'identification des patients présentant des facteurs de risque, le diagnostic précoce de la maladie ainsi que le suivi de son évolution dans le temps. Plusieurs biomarqueurs peptidiques issus de l'hydrolyse du collagène II, principal constituant du cartilage, sont actuellement utilisés en recherche clinique selon la classification BIPED (Burden of Disease, Investigation, Pronostic, Efficacy and Diagnostic). Leur dosage se fait par immunoanalyse qui utilise un anticorps (Ac) qui interagit spécifiquement avec un épitope donné. Cependant, la reconnaissance des épitopes par l'Ac peut être variable. En effet, les épitopes reconnus font partie de séquences peptidiques plus ou moins longues et plus ou moins modifiées (par modifications post traductionnelles). Les tests immunologiques peuvent en être perturbés et pour le moment ne sont pas utilisés en routine clinique . Dans ce projet, nous proposons donc de développer une méthode de mesure des biomarqueurs peptidiques de l'arthrose plus sensible et plus spécifique que par immunoessai, en deux étapes. La chromatographie liquide en ligne avec spectrométrie de masse haute résolution (LC MS HR) permettra d'identifier et de valider formellement le peptide le plus pertinent (sa séquence et modifications) contenant un épitope donné. Ce peptide sera ensuite mesuré par chromatographie liquide couplée avec un spectromètre de masse triple quadripôle (LC MS TQ), disponible en milieu hospitalier. Pour ces développements, la priorité se portera sur la famille de peptides coll2-1 développée par Y. Henrotin (P et D dans la classification BIPED). Le workflow que nous aurons développé (LCMSHR suivi de LCMSTQ) pourra ensuite être appliqué à d'autres épitopes décrits dans la littérature.

Cette étude s'effectuera au sein de l'ICP (équipe CAPRI) en collaboration avec l'hôpital Cochin et l'UMRS 1124 (équipe 'Degeneration and plasticity of the locomotor system').
Elle consistera dans un premier temps à identifier les peptides issus de l'hydrolyse du collagène II (constituant principal du cartilage) pour ensuite valider certains de ces peptides en tant que biomarqueurs de l'arthrose.

Analyse des peptides dans le liquide synovial, le plasma et les urines, en vu de valider des marqueurs précoces ou de suivi, de l'arthrose.

L'identification se fera par différentes méthodes d'analyse des peptides issus de l'hydrolyse du collagène II :
- digestion in silico
- digestion in vitro du collagène II commercial puis analyse par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse tandem en vu de l'identification des peptides et de leurs modifications post traductionnelles (cadre physiologique)
- extraction des peptides à partir des milieux biologiques puis analyse des extraits par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse tandem (cadre pathologique)
- validation des biomarqueurs après mise au point de leur analyse quantitative par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse tandem