Assistant Ingénieur en Virologie et Génomique Cliniques H/F

ENVT

Mission 1: virologie clinique (diagnostic et recherche): biologie moléculaire et sérologie

• Réceptionner, enregistrer et stocker les échantillons selon un protocole de qualité défini, Tenir un cahier d'expériences, rassembler les résultats, les mettre en forme et en rendre compte.
• Réaliser, à partir de protocoles définis, des expériences de préparation et d'analyse utilisant un ensemble de techniques, notamment en biologie moléculaire (PCR conventionnelle, PCR temps réel, PCR digitale) et en sérologie (ELISA essentiellement, IHA ou séroneutralisation).
• Actualiser le dossier de protocoles techniques.

Missions 2: métagénomique clinique

• Participer à la mise au point et mettre en oeuvre les méthodes spécifiques de préparation des acides nucléiques en vue du séquençage NGS (technologie Oxford Nanopore notamment)
• Préparer des banques de séquençage NGS, lancement des essais («runs») de séquençage.
• Sauvegarder des données de séquençage NGS

Mission 3: missions transversales d'appui à l'activité du laboratoire de virologie clinique

• Contribuer à la surveillance des équipements scientifiques, la maintenance de premier niveau et l'entretien du laboratoire
• Se former à la mise en oeuvre des nouvelles techniques dans le service et initier/accompagner les utilisateurs
• Appliquer, en situation de travail, les bonnes pratiques de laboratoire, les règles d'hygiène et de sécurité et celles spécifiques à la manipulation de certains produits
• Participer à la gestion des stocks et des commandes
• Contraintes d'hygiène et sécurité relatives au travail en L2 et L3.
• Travail prolongé sous poste de sécurité microbiologique.
• Station debout et/ou assise prolongée.

L'activité de l'agent s'exercera sous la responsabilité de l'ingénieur de recherche qui pilote le plateau de virologie et génomique de l'unité IHAP (équipe VIRAL), sous l'autorité du Directeur de l'Unité IHAP. Il/elle interagira au quotidien avec les chercheurs, doctorants de l'équipe VIRAL et d'autres équipes de l'UMR IHAP.

L'agent interagira également avec les services support de l'ENVT (administratifs, techniques et informatiques) et les interlocuteurs externes du laboratoire.