Ingénieur·e Biologiste en Analyse de Données H/F

Nantes Université

Missions

Notre groupe a accès à des données cliniques et à plusieurs données omiques longitudinales multiples (métabolome, lipidome, protéome) pour deux grandes cohortes françaises de patients gravement malades. Les missions de l'ingénieur seront de:

· caractériser l'effet de la pneumonie sur chaque omique,

· réaliser une intégration multi-omique

· évaluer si les signatures identifiées, par exemple la reprogrammation métabolique ou lipidique, sont associées à des événements cardiovasculaires ultérieurs.

Le candidat retenu sera chargé des analyses bioinformatiques du séquençage immunologique, de l'interprétation des analyses multi-omiques et de la rédaction d'un manuscrit.

Activités principales

· Concevoir, Développer, déployer et maintenir des méthodes d'analyses de données omiques:

Faire une revue de littérature, choisir des outils, les tester, les déployer sur le cluster d'analyse, les maintenir à jour et les utiliser dans le cadre de projets de recherche en cours au sein de l'équipe.

· Analyser des données de lipidomique, métabolomique et protéomique :

Controler la qualité, nettoyer, ordonner, normaliser, comparer les données et représenter les résultats scientifiques.

· Interagir avec les autres membres de l'équipe :

Discuter des choix méthodologiques, des résultats. Acquérir les connaissances sur le contexte biologique nécessaires à chaque projet. Participer à la valorisation des résultats, dont lors de la rédaction des publications scientifiques.

RETROUVEZ LA FICHE DE POSTE EN INTEGRALITE :https://www.univ-nantes.fr/universite/recrutement/nantes-universite-recrute-un-e-ingenieur-e-biologiste-en-analyse-de-donnees-cr2ti