Postdoctorant H/F

Ecole supérieure de physique et de chimie industrielles de la Ville de Paris

La densité exceptionnelle d'information et la stabilité chimique de l'ADN en font un support très prometteur pour le stockage numérique de données, permettant d'encoder des textes, images, vidéos, etc. en séquences nucléotidiques. Si les technologies de stockage de données dans l'ADN progressent rapidement, le calcul sur de vastes bases de données encodées en ADN reste largement inexploré et constitue une perspective fascinante pour le calcul moléculaire. Le développement de nouvelles méthodes sera nécessaire pour permettre la manipulation de données dans des mélanges moléculaires complexes : récupération d'information, accès aléatoire, recherche approximative, requêtes et filtrage, chiffrement, compression et bien d'autres tâches de traitement de l'information.

Le/la candidat.e aura pour mission de développer des algorithmes moléculaires pour traiter ces bases de données ADN. Il/elle se concentrera sur la conception et la mise en oeuvre expérimentale de circuits biochimiques sophistiqués, capables de répondre à des requêtes spécifiques (par exemple : « Quel est le plus court chemin pour aller du noeud X au noeud Y ? »). Il/elle s'appuiera sur la forte expertise du laboratoire dans la conception et l'assemblage de programmes moléculaires constitués d'oligonucléotides d'ADN et d'enzymes, capables de traiter de l'information. Les activités incluent:

- Revue de littérature et compilation de données

- Planification et réalisation d'expériences biochimiques (assemblage de réseaux de réactions biochimiques)

- Analyse des données et compte-rendu régulier (hebdomadaire)

- Communication scientifique (rédaction de publications scientifiques, participation à des conférences)