Assistant Ingénieur en Ingénierie et Synthèse de Peptides Antimicrobiens H/F

CNRS

Dans le cadre d'un projet collaboratif entre plusieurs laboratoires académiques associés au CNRS et basés à Grenoble, nous recrutons un assistant ingénieur dont les missions seront :
1. l'ingénierie, la synthèse en phase solide et solution et la caractérisation de peptides et dérivés peptidiques (travail réalisé au Département de Chimie Moléculaire, à Grenoble) https://dcm.univ-grenoble-alpes.fr/research ;
2. la caractérisation des activités de ces peptides antimicrobiens pour des applications antibiotiques et diagnostiques (travail réalisé au Laboratoire des Systèmes Moléculaires et nanoMatériaux pour l'Energie et la Santé, à Grenoble) https://www.symmes.fr/en .

Activités
Les activités porteront sur la planification de la synthèse de molécules peptidiques, selon une stratégie et des séquences discutées collectivement au sein du consortium.
La personne recrutée aura alors en charge :
- la production de ces molécules, en phase solide, mais éventuellement en phase liquide en fonction des contraintes ;
- la purification (HPLC) et le dosage (absorbance UV, pesée) des peptides synthétisés
- la caractérisation des molécules : spectrométrie de masse, éventuellement RMN proton et C13, spectroscopie de dichroïsme circulaire, etc.
- la mise en culture de souches bactériennes selon les procédures standards de microbiologie en laboratoire de classe 2 ;
- la mise en oeuvre de ces molécules pour en évaluer les propriétés antibiotiques selon des méthodes standardisées (mesure de CMI) ;
- la production de documents de synthèse : présentations orales, rapports écrits illustrant ses travaux.
Compétences
Le/la candidat/e aura une expertise en synthèse organique, de préférence en synthèse de biomolécules. Il aura des notions en technique de caractérisation tels que la chromatographie liquide et la spectrométrie de masse. Des connaissances en microbiologie seront très appréciées.
Le/la candidat/e devra obligatoirement être titulaire d'une licence ou équilavent (bachelor), en France ou à l'étranger.
Il/elle devrait montrer un intérêt pour la chimie bio-organique à l'interface avec les partenaires du projet (CHU Grenoble Alpes, DCM et SyMMES). Le/la candidat/e devra faire preuve d'autonomie et d'initiative, avoir une forte capacité de synthèse et être en mesure de rendre compte régulièrement de ses résultats face à ses encadrants directs mais également face aux partenaires du projet.
Contexte de travail

Le candidat sera recruté par le Centre National pour la Recherche Scientifique (CNRS) comme Assistant Ingénieur en Contrat à Durée Déterminée pour une durée de 18 mois.
Les peptides antimicrobiens constituent une alternative prometteuse aux antibiotiques grâce à leur large spectre d'action et à leur relative facilité de synthèse, même s'ils sont généralement moins stables in vivo que les composés organiques utilisés comme antibiotiques. Lors de travaux récemment réalisés conjointement au DCM et au SyMMES (les deux laboratoires partenaires de ce projet), de nouvelles séquences de peptides antimicrobiens d'une activité antimicrobienne remarquable sur différentes espèces de pathogènes bactériens, notamment par rapport aux thérapies antimicrobiennes actuellement disponibles. En s'appuyant sur ces résultats, le candidat aura pour objectifs de concevoir, synthétiser (en solution ou phase solide) et caractériser de nouveaux dérivés peptidiques présentant des activités biologiques renforcées, une spécificité accrue ainsi qu'une meilleure biodisponibilité et stabilité in vivo.
Les peptides seront préparés manuellement et en utilisant un synthétiseur automatisé via la méthode de synthèse peptidique en phase solide (SPPS). Ils seront analysés et purifiés par chromatographie liquide et caractérisés par spectrométrie de masse. Des techniques complémentaires de caractérisation pourront également être mises en oeuvre, telle que la résonance magnétique nucléaire (RMN) du proton et Carbone 13 ou le Dichroïsme Circulaire.
Les peptides seront ensuite évalués pour leur capacité à inhiber la croissance bactérienne de souches de pathogènes identifiées comme prioritaires dans la lutte contre l'antibiorésistance, mais également pour leur potentiel en termes de détection précoce de bactéries (SyMMES).
Le candidat sera recruté par le Centre National pour la Recherche Scientifique (CNRS) comme Assistant Ingénieur en Contrat à Durée Déterminée pour une durée de 18 mois.
Les peptides antimicrobiens constituent une alternative prometteuse aux antibiotiques grâce à leur large spectre d'action et à leur relative facilité de synthèse, même s'ils sont généralement moins stables in vivo que les composés organiques utilisés comme antibiotiques. Lors de travaux récemment réalisés conjointement au DCM et au SyMMES (les deux laboratoires partenaires de ce projet), de nouvelles séquences de peptides antimicrobiens d'une activité antimicrobienne remarquable sur différentes espèces de pathogènes bactériens, notamment par rapport aux thérapies antimicrobiennes actuellement disponibles. En s'appuyant sur ces résultats, le candidat aura pour objectifs de concevoir, synthétiser (en solution ou phase solide) et caractériser de nouveaux dérivés peptidiques présentant des activités biologiques renforcées, une spécificité accrue ainsi qu'une meilleure biodisponibilité et stabilité in vivo.
Les peptides seront préparés manuellement et en utilisant un synthétiseur automatisé via la méthode de synthèse peptidique en phase solide (SPPS). Ils seront analysés et purifiés par chromatographie liquide et caractérisés par spectrométrie de masse. Des techniques complémentaires de caractérisation pourront également être mises en oeuvre, telle que la résonance magnétique nucléaire (RMN) du proton et Carbone 13 ou le Dichroïsme Circulaire.
Les peptides seront ensuite évalués pour leur capacité à inhiber la croissance bactérienne de souches de pathogènes identifiées comme prioritaires dans la lutte contre l'antibiorésistance, mais également pour leur potentiel en termes de détection précoce de bactéries (SyMMES).
Contraintes et risques

Pas de contraintes particulières à signaler. Les risques seront ceux liés à la réalisation de travaux de chimie dans des laboratoires de chimie. Le suivi de formation de sécurité et sensibilisation au risque chimique sera obligatoire et dispensé dès la prise de poste.
Pas de contraintes particulières à signaler. Les risques seront ceux liés à la réalisation de travaux de chimie dans des laboratoires de chimie. Le suivi de formation de sécurité et sensibilisation au risque chimique sera obligatoire et dispensé dès la prise de poste.