Ingénieur·e Bio-Informaticien·ne en Gestion de Ressources sur la Plateforme de Bioinformatique de l'Institut de Biologie de l'Ens H/F CNRS

La personne recrutée contribuera d'une part aux activités liées à l'exploitation du cluster BioClust avec une implication prépondérante dans le support aux utilisateurs de l'IBENS et d'équipes externes, et d'autre part dans son administration et optimisation logicielle. Elle apportera de plus un soutien à l'animation scientifique en bioinformatique au sein de l'unité.
Activités
1) Support/administration du cluster BioClust:
- Former les utilisateurs à la structure du cluster, des règles d'utilisation, et du système de soumission (HT-Condor)
- Assurer un support aux utilisateurs : assistance, accompagnement, conseil et expertise auprès des utilisateurs dans le développement, le portage, l'optimisation ou le profilage de leurs codes
- Recueillir les besoins, évaluer et sélectionner les outils, logiciels et bibliothèques de calcul, de génération ou d'optimisation de code, etc. pertinents pour les utilisateurs.
- Superviser la bonne utilisation du cluster et prendre en charge les incidents de premier niveau
- Gérer administrativement le cluster (préparation de la facturation des coûts utilisateurs, appel à contribution pour le développement du cluster)
- Contribuer aux installations des logiciels nécessaires et participer à la mise en oeuvre des services d'infrastructures.
2) Animation scientifique en bioinformatique
- Prendre en charge la continuité de l'organisation des séminaires Bioinformatiques de l'unité (contact des présentateurs, organisation du planning, réservation de salle, diffusion des annonces)
- Participer aux activités de formation à l'utilisation des outils de bioinformatique
- Apporter une aide aux chercheurs pour l'organisation de leurs données scientifiques et contribuer à la rédaction des Plans de Gestion de données pour les réponses à appel à projet des équipes (une formation pourra être envisagée)

Compétences
- Pratique de l'utilisation des systèmes de type Unix et des langages de script Shell
- Maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation (Python, Perl, C, Java...)
- Connaissance du logiciel R
- Connaissance des architectures de clusters de calcul et intérêt pour le domaine ;
- Aisance dans l'expression orale et écrite ;
- Maîtrise de l'anglais technique du domaine, capacité à conduire des réunions et rédiger des documents dans cette langue ;
- Bonnes capacités relationnelles, autonomie et capacité d'initiative ;
- Aptitude au travail en équipe ;
- Connaissances et intérêt pour la recherche en biologie.

Contexte de travail

L'IBENS héberge, administre et met à la disposition de 3 laboratoires associés (IBENS, CIRB, ESPCI) un ensemble d'équipements de calcul intensif, parmi lesquels le cluster « BioClust », configurés et installés pour le traitement des données biologiques (séquences génomiques, imagerie, modélisation moléculaire, neurobiologie...) et organise de l'animation scientifique sous la forme de séminaires bio-informatiques réguliers.
Le poste sera rattaché à la plateforme informatique de l'IBENS (5 personnes) et travaillera en étroite collaboration avec la cellule cluster qui définit les orientations pour l'évolution des moyens de calcul de l'unité et participe au support utilisateurs.
L'IBENS héberge, administre et met à la disposition de 3 laboratoires associés (IBENS, CIRB, ESPCI) un ensemble d'équipements de calcul intensif, parmi lesquels le cluster « BioClust », configurés et installés pour le traitement des données biologiques (séquences génomiques, imagerie, modélisation moléculaire, neurobiologie...) et organise de l'animation scientifique sous la forme de séminaires bio-informatiques réguliers.
Le poste sera rattaché à la plateforme informatique de l'IBENS (5 personnes) et travaillera en étroite collaboration avec la cellule cluster qui définit les orientations pour l'évolution des moyens de calcul de l'unité et participe au support utilisateurs.

Contraintes et risques

Aucune
Aucune