Ingénieur d'Études - Ingénieure d'Études en Microbiologie H/F CNRS

L'ingénieur/l'ingénieure intégrera l'équipe « Cellulosomes et dégradation des polymères végétaux » du Laboratoire de Chimie Bactérienne (https://lcb.cnrs.fr/team/fierobe/). Il / Elle participera à la création de souches recombinantes de F. johnsoniae capables de sécréter en grande quantité des cellulases libres et des minicellulosomes fonctionnels, évaluera principalement leurs capacités de sécrétion et cellulolytiques, et améliorera ces capacités par évolution dirigée en laboratoire. Pour cela, il / elle mettra en oeuvre des techniques de biologie moléculaire, biologie synthétique, biochimie (purification, composition, activité enzymatique, analyse HPLC), évolution dirigée et séquençage pour produire de souches cellulolytiques et des enzymes/cocktails cellulolytiques modulables à façon, efficaces pour dégrader la biomasse cellulosique et intégrables dans des applications biotechnologiques.
Activités
- Mise en oeuvre et développement de technique de :
- biologie moléculaire (PCR, qPCR, clonage, construction de vecteurs d'expression et de mutants).
- biochimie des protéines (purification, électrophorèse, immunodétection, analyse HPLC)
- enzymologie (dégradation de la cellulose et es hémicelluloses)
- microbiologie (cultures aérobies)
- évolution dirigée en laboratoire
- Consignation, mise en forme et restitution écrite des résultats des expériences.
- Présentation orale en anglais.
- Participation aux exercices de communication dans l'équipe et sur le projet (fête de la science...)
- Implication dans le fonctionnement de l'équipe et de l'unité

Compétences
- Maîtrise des pratiques de microbiologie (travail avec les bactéries).
- Maîtrise des techniques de base de biologie moléculaire
- Connaissances en purification des protéines, enzymologie,
- Expérience en génétique, utilisation d'HPLC, statistiques
- Maîtrise du français et de l'anglais (oral et écrit)
- Rigueur, minutie, autonomie
- Bon relationnel et bonne communication

Contexte de travail

L'ingénieur / l'ingénieure intégrera l'équipe "Cellulosomes et dégradation des polymères végétaux" du LCB, constituée de 5 chercheurs et enseignant-chercheurs, 1 ingénieure d'étude, 2 étudiants en thèse. Cette équipe d'accueil fait partie du Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB, UMR7283), qui est une unité mixte de recherche CNRS-Aix Marseille Université, implantée sur le Campus CNRS Joseph Aiguier, à Marseille et fait partie de l'Institut de Microbiologie de la Méditerranée. Il / Elle travaillera sur le thème développé dans le cadre du projet PEPR B-BEST « Flavolases » (Hijacking the Flavobacterium type IX secretion machinery for efficient cellulolytic activity.) qui a pour objectifs d'explorer et d'exploiter le système très efficace de sécrétion de type IX (T9SS) des Flavobactéries pour concevoir une biocatalyse cellulolytique efficace à partir de Flavobacterium johnsoniae. L'objectif final du projet est de mieux comprendre le fonctionnement du T9SS récemment découvert et de développer une méthode de production efficace et peu coûteuse de cocktails cellulolytiques modulables à façon et de souches sécrétrices et cellulolytiques, tous deux intégrables dans des applications biotechnologiques utilisant la biomasse cellulosique, un énorme réservoir renouvelable de carbone permettant la production durable de biocarburants ou de produits chimiques. Il / Elle travaillera sous la direction d'Henri-Pierre Fierobe (chef d'equipe, DR2 CNRS) et de Nicolas Vita (CRCN CNRS) en collaboration avec les membres de l'équipe d'accueil et celles des deux autres partenaires du projet Flavolases : le Génoscope (CEA Évry-Courcouronnes) et le Laboratoire d'ingénierie des systèmes Macromoléculaires (LISM, CNRS Marseille).

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
L'ingénieur / l'ingénieure intégrera l'équipe "Cellulosomes et dégradation des polymères végétaux" du LCB, constituée de 5 chercheurs et enseignant-chercheurs, 1 ingénieure d'étude, 2 étudiants en thèse. Cette équipe d'accueil fait partie du Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB, UMR7283), qui est une unité mixte de recherche CNRS-Aix Marseille Université, implantée sur le Campus CNRS Joseph Aiguier, à Marseille et fait partie de l'Institut de Microbiologie de la Méditerranée. Il / Elle travaillera sur le thème développé dans le cadre du projet PEPR B-BEST « Flavolases » (Hijacking the Flavobacterium type IX secretion machinery for efficient cellulolytic activity.) qui a pour objectifs d'explorer et d'exploiter le système très efficace de sécrétion de type IX (T9SS) des Flavobactéries pour concevoir une biocatalyse cellulolytique efficace à partir de Flavobacterium johnsoniae. L'objectif final du projet est de mieux comprendre le fonctionnement du T9SS récemment découvert et de développer une méthode de production efficace et peu coûteuse de cocktails cellulolytiques modulables à façon et de souches sécrétrices et cellulolytiques, tous deux intégrables dans des applications biotechnologiques utilisant la biomasse cellulosique, un énorme réservoir renouvelable de carbone permettant la production durable de biocarburants ou de produits chimiques. Il / Elle travaillera sous la direction d'Henri-Pierre Fierobe (chef d'equipe, DR2 CNRS) et de Nicolas Vita (CRCN CNRS) en collaboration avec les membres de l'équipe d'accueil et celles des deux autres partenaires du projet Flavolases : le Génoscope (CEA Évry-Courcouronnes) et le Laboratoire d'ingénierie des systèmes Macromoléculaires (LISM, CNRS Marseille).

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.