Ingénieur·e Analyse d'Images et Données en Biologie Spatiale H/F

Pôle Emploi

MISSION PRINCIPALE : Sous la responsabilité du Directeur du Pôle Technologique (PT) et encadré.e par une Ingénieure de recherche, l'Ingénieur.e de recherche vise à augmenter le potentiel du plateau d'Imagerie pour répondre à des besoins croissants en analyse d'images et de données issues des approches de biologie spatiale. L'ingénieur.e travaillera en interaction avec les différentes équipes du centre et contribuera activement au développement de stratégies analytiques innovantes. La personne recrutée pourra, en plus, bénéficier de la présence sur site de l'équipe projet de l'Institut de Recherche en Informatique de Toulouse pour développer ses compétences en analyse d'image.
La plateforme dispose d'une gamme variée de microscopes qui permettent de couvrir un large éventail de techniques et réalisent des observations à différentes échelles :
Pour l'imagerie structurelle et vivante :
2 microscopes confocaux à balayage laser : LSM780 - LSM980 Airyscan2
1 microscope confocal à disque rotatif spinning disk : Cicero sur Zeiss Axio-observer Z1
1 système d'imagerie à haut débit (HCS) : PerkinElmer Opera Phenix
1 système d'imagerie entièrement automatisé pour cellules vivantes : IncucyteS3
Pour l'imagerie spatial-protéomique :
1 Phenocycler-Fusion (Akoya)

ACTIVITES PRINCIPALES :
1. Analyse et traitement des bioimages Réaliser l'analyse d'images issues des différentes technologies du plateau (ImageJ/Fiji, Imaris, stations d'analyse, etc.). Développer des pipelines d'analyse d'images et de traitement de données pour extraire de manière automatisée et robuste les informations pertinentes. Intégrer des approches récentes (intelligence artificielle, deep learning, machine learning) pour améliorer la segmentation, la quantification et l'interprétation des données.
2. Analyses de données en bioinformatique et spatial-omics Traiter et analyser les données de biologie spatiale, depuis les données brutes jusqu'à la restitution et l'interprétation des résultats., Développer et adapter des outils d'analyse spécifiques pour les données multi-omiques spatiales, Participer aux projets scientifiques en collaboration avec les équipes de recherche du CRCT

SPECIFICITE: Travail en plateforme, multiplicité des projets

EXPERIENCE DANS LE DOMAINE DE LA MICROSCOPIE EST FORTEMENT SOUHAITEE + Bac +5 MINIMUM

AVANTAGES :
32 jours de Congés Annuels et 13 jours de RTT
Restauration collective subventionnée sur place
Comité d'action et entraide sociale (prestations sociales, culturelles, sportives)
Transports publics remboursés à 75%