Chercheur - Chercheuse en Microbiologie H/F CNRS

Les éléments transposables ont un impact sur l'organisation et l'intégrité du génome et sur le processus d'élimination programmée de l'ADN (PDE) du cilié unicellulaire Tetrahymena thermophila avec des mécanismes impliquant des petits ARN non codants. Pour mieux comprendre ce mécanisme moléculaire, nous utilisons la méthode de knock-down des gènes basée sur CRISPR-Cas13d. Le travail de la personne recrutée consistera notamment à établir des méthodes de tri par cytométrie séparant les cellules et les noyaux (macronoyau somatique MAC et micronoyau germinal MIC) qui sont défectueux dans les différentes étapes de la PDE afin d'identifier et de caractériser des gènes non encore décrits et impliqués dans la PDE. L'agent recruté utilisera la microscopie de fluorescence pour documenter les cellules ou noyaux triés par cytométrie en flux et sera aussi en charge d'entretenir les cultures des souches de ciliés. Enfin une analyse des données quantitative sera effectuée (avec traitement des statistiques sous R).
Activités
- Cytométrie en flux : analyse, tri et traitement des données spectrales (principale)
- Cultures de microorganismes unicellulaires ciliés eucaryotes en conditions stériles(principale)
- Microscopie (contraste de phase et fluorescence) (principale)
- Analyse de données quantitatives et statistiques avec le logiciel R (secondaire)
- Encadrement d'étudiants et stagiaires (principale)
- Présentation des résultats à la communauté scientifique (poster et congrès en anglais) (principale)
- Valorisation des travaux sous forme de publication scientifique (principale)

Compétences
- Compétences en cytométrie de flux (obligatoires) et en microscopie (pouvant être acquises sur place)
- Traitement des données spectrales en cytométrie de flux
- Compétences en microbiologie (cultures axéniques)
- Analyse des données quantitatives et statistiques avec R
- Anglais lu et parlé
- Capacité de communication et d'interaction avec les autres membres de l'équipe / laboratoire
- Présentation des résultats scientifiques (poster et congrès en anglais), synthèse bibliographique et participation à l'écriture de publications

Contexte de travail

Le candidat/la candidate travaillera au sein du LCB UMR7283 situé sur le campus Joseph Aiguier à Marseille dans le 9°arrondissement.
Le projet est à l'interface de deux laboratoires, le Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB) et l'Institut de Génétique Humaine (IGH) de Montpellier. Les expériences seront effectuées sur le campus CNRS de J. Aiguier.
Le candidat/la candidate travaillera au sein du LCB UMR7283 situé sur le campus Joseph Aiguier à Marseille dans le 9°arrondissement.
Le projet est à l'interface de deux laboratoires, le Laboratoire de Chimie Bactérienne (LCB) et l'Institut de Génétique Humaine (IGH) de Montpellier. Les expériences seront effectuées sur le campus CNRS de J. Aiguier.